search query: @keyword Bayesian networks / total: 9
reference: 5 / 9
Author: | Matilainen, Jukka |
Title: | A probabilistic modeling toolkit for a systems biology software platform |
Probabilistinen mallinnustyökalu systeemibiologista ohjelmistoalustaa varten | |
Publication type: | Master's thesis |
Publication year: | 2007 |
Pages: | xii + 61 + (19) Language: eng |
Department/School: | Tietotekniikan osasto |
Main subject: | Informaatiotekniikka (T-61) |
Supervisor: | Kaski, Samuel |
Instructor: | Törmä, Anssi |
OEVS: | Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning CentreIn the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network. The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/ You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.
Logging on to the customer computers
Opening a thesis
Reading the thesis
Printing the thesis
|
Location: | P1 Ark Aalto 5314 | Archive |
Keywords: | systems biology modelling Bayesian networks workflow software systeemibiologia mallinnus Bayes- verkot workflow ohjelmistot |
Abstract (fin): | Viime vuosina systeemibiologian nousu keskeiseksi paradigmaksi on muuttanut biologista tutkimusta. Biologit ja bioinformaatikot turvautuvat yhä useammin laskennallisiin menetelmiin pystyäkseen tulkitsemaan havaintoja ja kokeellista aineistoa. Ohjelmistojen tarjoama tuki on olennaisessa roolissa tutkimustyössä. Niin sanottuja workflow- ohjelmistoja voidaan hyödyntää laskennallisen biologian data-analyysivaiheiden suunnitteluun, dokumentointiin ja suoritukseen. Sekä kvalitatiivisia että kvantitatiivisia malleja tarvitaan biologisten järjestelmien toiminnan ymmärtämiseen. Biologian monimutkainen maailma on erityisen haastava mallinnettava, sillä siihen liittyy monia epävarmuuden lähteitä. Probabilistiset mallit ovat osoittautuneet erittäin sopiviksi tämäntyyppisten järjestelmien mallintamiseen. Bayes- verkot ovat nousseet erittäin suosituksi probabilististen graafimallien perheeksi laskennallisen biologisen tutkimuksen apuvälineinä. Tässä diplomityössä suunnitellaan probablistinen mallinnuskirjasto Medical Oy:n workflow-ohjelmistojärjestelmälle. Työssä toteutetaan kirjastoon eräs keskeinen osa, ohjelmistotyökalu, joka suorittaa päättelyä käyttäjän määrittelemällä Bayes-verkolla. Lisäksi työssä suunnitellaan Bayes-verkoille tietomalli ja tiedostoformaatti, joita mallinnuskirjasto ja toteutettu työkalu hyödyntävät. |
ED: | 2007-11-16 |
INSSI record number: 34872
+ add basket
INSSI