search query: @keyword DNA origami / total: 8
reference: 7 / 8
Author: | Eerikäinen, Marika |
Title: | DNA origami-based enzyme nanoreactor |
DNA origami -pohjainen entsyyminanoreaktori | |
Publication type: | Master's thesis |
Publication year: | 2014 |
Pages: | vi + 38 s. + liitt. 5 Language: eng |
Department/School: | Sähkötekniikan korkeakoulu |
Main subject: | Biologinen kemia ja biomateriaalit (KE3005) |
Supervisor: | Kostiainen, Mauri |
Instructor: | Linko, Veikko |
Electronic version URL: | http://urn.fi/URN:NBN:fi:aalto-201501081048 |
OEVS: | Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning CentreIn the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network. The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/ You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.
Logging on to the customer computers
Opening a thesis
Reading the thesis
Printing the thesis
|
Location: | P1 Ark Aalto 2507 | Archive |
Keywords: | DNA origami DNA nanotechnology horseradish peroxidase glucose oxidase nanoreactor enzyme cascade piparjuuriperoksidaasi glukoosioksidaasi nanoreaktori entsyymikaskadi DNA nanoteknologia |
Abstract (eng): | In this thesis the concept of DNA origami and enzyme nanoreactor is introduced. A modular enzymatic DNA origami nanoreactor is designed and assembled and the successfull folding is confirmed with agarose gel electrophoresis and transmission electron microscopy images. The nanoreactor consists of two monomer origamis, one equipped with glucose oxidase (GOx) enzyme and one with horseradish peroxidase (HRP) enzyme. The attachment is accomplished using non-covalent but strong biotin-avidin binding. In proof-of-concept experiments first the activity of individual monomer units is examined measuring the change of concentration of reporter agent tetramethylbenzidine diimine (TMB*) with UV-Vis spectrophotometry. Next the dimer origamis are formed from two monomer units and finally the efficient GOx/HRP enzyme-pair cascade reaction is demonstrated. The reactor could be utilised as a nanoscale diagnostic tool, and modularity of the proposed system would further enable more complex reactions. |
Abstract (fin): | Tämä diplmomityö käsittelee DNA origamin teoriaa, valmistusta sekä sovelluksia. Tutkimusosiossa suunnitellaan ja valmistetaan DNA origami -tekniikalla entsymaattinen nanoreaktori. Prosessin onnistuminen ja DNA origamien korkea saanto varmistetaan agaroosigeelielektroforeesilla sekä läpäisyelektronimikroskooppikuvilla. Nanoreaktori muodostetaan kahdesta monomeeriyksiköstä, joista toinen sisältää glukoosioksidaasientsyymin (GOx) ja toinen piparjuurioksidaasientsyymin (HRP). Entsyymien kiinnitysmenetelmänä käytetään ei-kovalenttista, mutta silti vahvaa biotiini-avidiinisidosta. Ennen dimeerin kokoamista, yksittäisten monomeerituubien entsyymiaktiivisuus mitataan detektoimalla reportterina toimivan tetrametyylibenzidiinin di-imiinin (TMB*) konsentraation muutosta UV/Vis spektrofotometrialla. Seuraavaksi muodostetaan dimeeri liittämällä kaksi monomeerituubia yhteen ja lopulta demonstroidaan GOx/HRP -entsyymiparin kaskadireaktio nanoreaktorin sisällä. Esiteltyä reaktoria voidaan tulevaisuudessa hyödyntää erilaisina nanomittakaavan diagnostiikkatyökaluina ja DNA origamituubien modulaarisuus mahdollistaa myös monimutkaisemmat katalyysireaktiosarjat. |
ED: | 2015-01-18 |
INSSI record number: 50410
+ add basket
INSSI