haku: @instructor Roivainen, Merja / yhteensä: 12
hakutulos-lista
viite: 8 / 12
« edellinen | seuraava »
Tekijä:Kahelin, Heidi
Työn nimi:Poliorekombinanttiviruksen alustava karakterisointi
Preliminary characterization of a recombinant poliovirus
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2008
Sivut:ix + 105 s. + liitt. 9      Kieli:   fin
Koulu/Laitos/Osasto:Biotekniikan ja kemian tekniikan laitos
Oppiaine:Biokemia ja mikrobiologia   (Kem-30)
Valvoja:Nordström, Katrina
Ohjaaja:Roivainen, Merja
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje
sulje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark TKK  5076   | Arkisto
Tiivistelmä (fin): Tämän diplomityön tarkoituksena oli tutkia enterovirusten, erityisesti poliovirusten ja muiden HEV-C- ryhmään kuuluvien virusten rekombinaatiota sekä rekombinaatiosta seuraavia muutoksia viruksen geno- ja fenotyypissä.

Kirjallisuusosan alussa tarkastellaan yleisesti enteroviruksia, niiden luokittelua, replikaatiosykliä ja epidemiologiaa.
Työn jälkiosa käsittelee polioviruksia ja muita HEV-C-ryhmän enteroviruksia, poliorokotteita, rokotepoliovirusten attenuaatiota ja reversiota sekä enterovirusten rekombinaatiota.

Tutkimusosassa tutkittiin kahta KTL:n näytekokoelmaan kuuluvaa esikäsiteltyä näytettä.
Näytteet olivat peräisin tutkimuksesta, jossa Valko- Venäläisen lastenkodin OPV-rokotetuilta lapsilta kerättiin ulostenäytteitä 9 viikon ajan jokaisen rokotuskerran jälkeen.
Näytteet teki erityisen mielenkiintoisiksi niissä rokotepoliovirusten kanssa samaan aikaan havaitut CVA-24-virukset, sillä HEV-C-ryhmän virukset rekombinoituvat usein keskenään.
Lisäksi alustavien RFLP-analyysien perusteella työssä tutkittujen kahden näytteen viruksia oli syytä epäillä nonpolio-polio-rekombinanteiksi.

Plakkipuhdistetuista virusnäytteistä sekvensoitiin kolme kohtaa eri puolita genomia, ja tuloksista pääteltiin toisen näytteistä sisältävän S3/S1-rekombinanttivirusta.
Toinen näyte osoittautui tässä työssä tavalliseksi rokotepoliovirukseksi.
Rekombinantiksi todetun viruksen lähes koko genomisekvenssi määritettiin ja lisäksi tutkittiin rekombinantin ja sen parentaalikantojen kasvunopeutta kolmessa eri solulinjassa.

Rekombinanin S3/S1-viruksen rekombinaatiokohta määritettiin emästen 5015-5020 kohdalle, aivan 2C- helikaasia koodaavan genomin alueen päähän.
Viruksessa, jonka genomista suurin osa oli peräisin Sabin 3-rokotepoliovirukselta, oli tapahtunut kaksi kolmesta tärkeimmästä sen attenuaatioon vaikuttavasta reversiomutaatiosta.
Näistä mutaatioista ensimmäinen oli U472C replikaatiota säätelevällä 5-UTR-alueella ja toinen, C2493U, VP1-kapsidiproteiinialueella.

Rekombinanttiviruksella ja sen parentaalikannoilla tehdyissä kasvukäyrissä havaittiin viruksen muistuttavan kasvunopeudeltaan HeLa- ja hermosoluperäisissä SK-N-SH-solulinjoissa enemmän S3 :a nopeampaa S1- virusta, jolta rekombinantin genomin loppupää ja 3D-polymeraasi olivat peräisin.
Suoliston CaCo-2-solulinjassa eri kantojen välillä selvää eroa ei ollut havaittavissa.
Rekombinantin kasvunopeus ja attenuaation heikentyminen näytti siis riippuvan tutkitusta solutyypistä.

Tutkimustulokset auttavat osaltaan ymmärtämään paremmin miksi poliovirusten rekombinaatio on niin yleistä.
Työssä saadut tulokset ovat samansuuntaisia aiempien rekombinanttitutkimusten kanssa ja tukevat havaintoja rekomhinaation vaikutuksesta viruksen elinkykyyn.
ED:2008-06-02
INSSI tietueen numero: 35706
+ lisää koriin
« edellinen | seuraava »
INSSI