haku: @keyword gene expression / yhteensä: 13
viite: 6 / 13
Tekijä:Mohammadi, Pejman
Työn nimi:Bayesian integrative modelling of metabolic and transcriptional data using pathway information
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2010
Sivut:vi + 54      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Informaatio- ja luonnontieteiden tiedekunta
Oppiaine:Informaatiotekniikka   (T-61)
Valvoja:Kaski, Samuel
Ohjaaja:Salojärvi, Jarkko
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark Aalto  6904   | Arkisto
Avainsanat:integrative modelling
gene expression
metabolic measurement
stoichiometry
metabolic network modelling
bayesian analysis
Tiivistelmä (eng): One of the rising trends in computational systems biology is to characterize biological systems through integrated analysis of different sources of biological information.
While gene expression and metabolic measurements are among the most prevalent biological information sources their integration is problematic due to the difficulties raised by the high dimensionality of the datasets, excessive noise and lack of data samples.

The biochemical skeleton of metabolism has been extensively studied an widely used for simulating the metabolic behaviours in cells.
Nevertheless, the rigid structure of metabolism can also be utilized as a scaffold for analysis of the genome-scale datasets.
This helps to manage the high dimensionality and noise more effectively while also providing a natural link for integrating several omics datasets in the mean time.

The ultimate goal of the work presented in this thesis is to develop a novel data fusion scheme by taking advantage of the genome-scale reconstructed models of metabolism as prior knowledge for integrated analysis of transcriptional and metabolic measurements.
ED:2010-10-13
INSSI tietueen numero: 41073
+ lisää koriin
INSSI