haku: @supervisor Aurell, Erik / yhteensä: 13
hakutulos-lista
viite: 8 / 13
« edellinen | seuraava »
Tekijä:Golumbeanu, Monica
Työn nimi:Statistical analysis of PAR-CLIP data
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2013
Sivut:51      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Perustieteiden korkeakoulu
Oppiaine:Informaatiotekniikka   (T-61)
Valvoja:Lähdesmäki, Harri ; Aurell, Erik ; Beerenwinkel, Niko
Ohjaaja:Mohammadi, Pejman
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje
sulje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark Aalto     | Arkisto
Avainsanat:statistical modeling
PAR-CLIP
RNA-binding proteins
Bayesian analysis
Tiivistelmä (eng): From creation to its degradation, the RNA molecule is the action field of many binding proteins with different roles in regulation and RNA metabolism.
Since these proteins are involved in a large number of processes, a variety of diseases are related to abnormalities occurring within the binding mechanisms.
One of the experimental methods for detecting the binding sites of these proteins is PAR-CLIP built on the next generation sequencing technology.
Due to its size and intrinsic noise, PAR-CLIP data analysis requires appropriate pre-processing and thorough statistical analysis.

The present work has two main goals.
First, to develop a modular pipeline for pre-processing PAR-CLIP data and extracting necessary signals for further analysis.
Second, to devise a novel statistical model in order to carry out inference about presence of protein binding sites based on the Signals extracted in the pre-processing step.
ED:2013-09-25
INSSI tietueen numero: 47249
+ lisää koriin
« edellinen | seuraava »
INSSI