haku: @keyword bioinformatiikka / yhteensä: 14
hakutulos-lista
viite: 14 / 14
« edellinen | seuraava »
Tekijä:Salmia, Ilari
Työn nimi:Search Systems in Bioinformatics
Hakujärjestelmät bioinformatiikassa
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2004
Sivut:66+11      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Tietotekniikan osasto
Oppiaine:Ohjelmistotekniikka   (T-106)
Valvoja:Soisalon-Soininen, Eljas
Ohjaaja:Volanen, Jussi
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje
sulje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark Aalto     | Arkisto
Avainsanat:search system
search engine
bioinformatics
relational database
SQL
hakujärjestelmä
hakukone
bioinformatiikka
relaatiotietokanta
SQL
Tiivistelmä (fin):Erilaisen tiedon määrä bioinformatiikassa on valtaisa.
Jotta tutkija pystyisi suodattamaan haluamansa tiedon ulos, tarvitaan tehokas hakujärjestelmä, joka pystyy muuntautumaan käyttäjän tarpeisiin sopivaksi.

Työssä esitellään menetelmä, kuinka tehdä monipuolisia ja monimutkaisia hakuja relaatiotietokannasta.
Nämä haut voivat olla erilaisia joka kerta, eikä näin ollen tutkijan ole pakko tyytyä ennaltamääriteltyihin, kiinteisiin hakuvaihtoehtoihin.
Hakujärjestelmää varten relaatiotietokantaan on yhdistetty eri biologisia tietokantoja.
Nämä tietokannat ovat usein vapaasti käytettävissä ja saatavilla.
Eri tieteelliset organisaatiot ylläpitävät näitä tietokantoja kukin omassa muodossaan, eikä hakuja yhdistäen eri tietokantoja samaan yhteiseen hakuun juurikaan tueta.

Suunnittelun pohjalta on toteuttu käyttäen Java-ohjelmointikieltä hakujärjestelmä, joka tuottaa hakukyselyitä annetuista ehdoista.
Työn kannalta hakujärjestelmän käyttäjä on toinen ohjelmisto, kuten esimerkiksi graafinen käyttöliittymä, joka tuottaa hakukyselyitä ihmiskäyttäjälle.
Käyttöliittymän tehtäväksi jää muuttaa käyttäjän antamat ehdot hakujärjestelmän ymmärtämään muotoon sekä näyttämään hakutulokset.
Käyttöliittymän lisäksi myös muut tietokantahakuja tarvitsevat sovellukset voivat hyödyntää rakennettua hakujärjestelmää.

Hakujärjestelmä tietää, millä ehdoilla tietoa voidaan hakea, eikä tätä tietoa tarvitse kovakoodata esimerkiksi käyttöliittymään.
Tämä saavutetaan muuttamalla käytössä oleva tietomalli tietokoneen ymmärtämään muotoon.
Tietomalli sisältää kaiken hakujärjestelmän tarvitsevan informaation.
Se tietää mitä asiakokonaisuutta voi hakea milläkin kriiterillä sekä kuinka nämä asiakokonaisuudet liittyvät toisiinsa.

Tässä työssä saavutetut tulokset osoittavat, että hakujärjestelmällä pystytään tuottamaan monipuolisia hakukyselyitä.
Esitetty hakuehtojen välittäminen on tarpeeksi rikas välittämään hakuehdot monimutkaisen tietomallin ollessa käytössä.
ED:2004-03-03
INSSI tietueen numero: 21271
+ lisää koriin
« edellinen | seuraava »
INSSI