haku: @keyword bioinformatiikka / yhteensä: 14
hakutulos-lista
viite: 9 / 14
« edellinen | seuraava »
Tekijä:Lindfors, Erno
Työn nimi:Investigating the structure of integrated biological networks
Integroitujen biologisten verkkojen tutkiminen
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2005
Sivut:x + 61 s. + liitt.      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Sähkö- ja tietoliikennetekniikan osasto
Oppiaine:Tietoverkkotekniikka   (S-38)
Valvoja:Hollmén, Jaakko
Ohjaaja:Oresic, Matej
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje
sulje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark TKK  2702   | Arkisto
Avainsanat:data visualizing and clustering
robustness
network topologies
bioinformatics
tiedon visualisointi ja klusterointi
robustisuus
verkkotopologiat
bioinformatiikka
Tiivistelmä (fin): Nykyajan biologinen tieto on erittäin hajanaista.
Sitä säilytetään eri tietokannoissa ja se esitetään eri formaateissa.
On olemassa paljon biologisia tietokantoja hyvine visualisointityökaluineen.
Tästä huolimatta on olemassa erittäin vähän työkaluja, joiden avulla tietoa pystytään hakemaan useasta tietokannasta.
Tämän takia on erittäin vaikeata saada selvää kokonaiskuvaa monimutkaisesta biologisesta tiedosta.
Tässä työssä kehitämme Java-sovelluksen, jonka avulla voimme hakea useasta biologisesta tietokannasta.

Viimeaikaisten tutkimusten perusteella hierarkinen modulaarisuus vallitsee aineenvaihduntaverkoissa.
Tämän takia ne ovat erittäin robusteja.
Emme kuitenkaan tiedä miten tämä rakenne muuttuu, kun lisäämme aineenvaihduntaverkkoihin uusia biologisia verkkoja.

Käytämme Sammonin projektioalgoritmia tutkiaksemme biologisten verkkojen rakennetta Leipurin hiivassa.
Aluksi klusteroimme aineenvaihduntaverkkoja.
Tämän jälkeen lisäämme aineenvaihduntaverkkoihin proteiini-proteiini vuorovaikutusverkkoja.
Korkeilla hierarkiatasoilla tapahtuu voimakasta sekoitusta.
Alemmilla hierarkiatasoilla sekoitukset ovat huomattavasti heikompia.
Korkeiden ja matalien hierarkiatasojen välillä ei tapahdu ollenkaan sekoitusta.
ED:2005-06-20
INSSI tietueen numero: 28891
+ lisää koriin
« edellinen | seuraava »
INSSI