haku: @keyword bioinformatiikka / yhteensä: 14
viite: 7 / 14
Tekijä:Hupponen, Taavi
Työn nimi:Using Web Services Technology for Integration in Bioinformatics
Web services -tekniikoiden käyttö bioinformatiikkapalveluiden integroinnissa
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2007
Sivut:(8) + 66      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Tietotekniikan osasto
Oppiaine:Ohjelmistotekniikka   (T-106)
Valvoja:Soisalon-Soininen, Eljas
Ohjaaja:Lehtovuori, Pekka
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark Aalto     | Arkisto
Avainsanat:Web services
bioinformatics
integration
stateful Web services
attachments
SOAP
service-oriented architecture
tilan hallinta
integrointi
liitetiedostot
palvelukeskeiset arkkitehtuurit
bioinformatiikka
Tiivistelmä (eng): In bioinformatics, there is a need for integration in the form of enabling programmatic remote access for databases and analysis tools.
Such service integration makes it possible to build powerful workflows and analysis platforms and also reduces local maintenance burdens.

Suitability of Web services technology for such integration is investigated from the point of view of a service provider, by implementing a Web service interface for a sequence alignment database.
Special attention is paid to interoperability, managing state and large binary files.

Web services are found to be a potential technology, providing good interoperability and loose coupling.
Requirements of state management and dealing with large binary data are addressed, though not without problems.
Due to abundance of various specifications, of which many are still developing, Web services is found to support many features, although capable tools are needed for taking advantage of them.

In conclusions, the importance of understanding the challenges of integration is emphasized, in addition to using a suitable technology and capable tools.
ED:2007-04-30
INSSI tietueen numero: 33741
+ lisää koriin
INSSI