haku: @keyword workflow / yhteensä: 18
viite: 8 / 18
Tekijä: | Matilainen, Jukka |
Työn nimi: | A probabilistic modeling toolkit for a systems biology software platform |
Probabilistinen mallinnustyökalu systeemibiologista ohjelmistoalustaa varten | |
Julkaisutyyppi: | Diplomityö |
Julkaisuvuosi: | 2007 |
Sivut: | xii + 61 + (19) Kieli: eng |
Koulu/Laitos/Osasto: | Tietotekniikan osasto |
Oppiaine: | Informaatiotekniikka (T-61) |
Valvoja: | Kaski, Samuel |
Ohjaaja: | Törmä, Anssi |
OEVS: | Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossaOppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa. Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/ Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.
Kirjautuminen asiakaskoneille
Opinnäytteen avaaminen
Opinnäytteen lukeminen
Opinnäytteen tulostus
|
Sijainti: | P1 Ark Aalto 5314 | Arkisto |
Avainsanat: | systems biology modelling Bayesian networks workflow software systeemibiologia mallinnus Bayes- verkot workflow ohjelmistot |
Tiivistelmä (fin): | Viime vuosina systeemibiologian nousu keskeiseksi paradigmaksi on muuttanut biologista tutkimusta. Biologit ja bioinformaatikot turvautuvat yhä useammin laskennallisiin menetelmiin pystyäkseen tulkitsemaan havaintoja ja kokeellista aineistoa. Ohjelmistojen tarjoama tuki on olennaisessa roolissa tutkimustyössä. Niin sanottuja workflow- ohjelmistoja voidaan hyödyntää laskennallisen biologian data-analyysivaiheiden suunnitteluun, dokumentointiin ja suoritukseen. Sekä kvalitatiivisia että kvantitatiivisia malleja tarvitaan biologisten järjestelmien toiminnan ymmärtämiseen. Biologian monimutkainen maailma on erityisen haastava mallinnettava, sillä siihen liittyy monia epävarmuuden lähteitä. Probabilistiset mallit ovat osoittautuneet erittäin sopiviksi tämäntyyppisten järjestelmien mallintamiseen. Bayes- verkot ovat nousseet erittäin suosituksi probabilististen graafimallien perheeksi laskennallisen biologisen tutkimuksen apuvälineinä. Tässä diplomityössä suunnitellaan probablistinen mallinnuskirjasto Medical Oy:n workflow-ohjelmistojärjestelmälle. Työssä toteutetaan kirjastoon eräs keskeinen osa, ohjelmistotyökalu, joka suorittaa päättelyä käyttäjän määrittelemällä Bayes-verkolla. Lisäksi työssä suunnitellaan Bayes-verkoille tietomalli ja tiedostoformaatti, joita mallinnuskirjasto ja toteutettu työkalu hyödyntävät. |
ED: | 2007-11-16 |
INSSI tietueen numero: 34872
+ lisää koriin
INSSI