haku: @keyword workflow / yhteensä: 18
viite: 9 / 18
Tekijä:Matilainen, Jukka
Työn nimi:A probabilistic modeling toolkit for a systems biology software platform
Probabilistinen mallinnustyökalu systeemibiologista ohjelmistoalustaa varten
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2007
Sivut:xii + 61 + (19)      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Tietotekniikan osasto
Oppiaine:Informaatiotekniikka   (T-61)
Valvoja:Kaski, Samuel
Ohjaaja:Törmä, Anssi
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark Aalto  5314   | Arkisto
Avainsanat:systems biology
modelling
Bayesian networks
workflow
software
systeemibiologia
mallinnus
Bayes- verkot
workflow
ohjelmistot
Tiivistelmä (fin):Viime vuosina systeemibiologian nousu keskeiseksi paradigmaksi on muuttanut biologista tutkimusta.
Biologit ja bioinformaatikot turvautuvat yhä useammin laskennallisiin menetelmiin pystyäkseen tulkitsemaan havaintoja ja kokeellista aineistoa.
Ohjelmistojen tarjoama tuki on olennaisessa roolissa tutkimustyössä.
Niin sanottuja workflow- ohjelmistoja voidaan hyödyntää laskennallisen biologian data-analyysivaiheiden suunnitteluun, dokumentointiin ja suoritukseen.

Sekä kvalitatiivisia että kvantitatiivisia malleja tarvitaan biologisten järjestelmien toiminnan ymmärtämiseen.
Biologian monimutkainen maailma on erityisen haastava mallinnettava, sillä siihen liittyy monia epävarmuuden lähteitä.
Probabilistiset mallit ovat osoittautuneet erittäin sopiviksi tämäntyyppisten järjestelmien mallintamiseen.
Bayes- verkot ovat nousseet erittäin suosituksi probabilististen graafimallien perheeksi laskennallisen biologisen tutkimuksen apuvälineinä.

Tässä diplomityössä suunnitellaan probablistinen mallinnuskirjasto Medical Oy:n workflow-ohjelmistojärjestelmälle.
Työssä toteutetaan kirjastoon eräs keskeinen osa, ohjelmistotyökalu, joka suorittaa päättelyä käyttäjän määrittelemällä Bayes-verkolla.
Lisäksi työssä suunnitellaan Bayes-verkoille tietomalli ja tiedostoformaatti, joita mallinnuskirjasto ja toteutettu työkalu hyödyntävät.
ED:2007-11-16
INSSI tietueen numero: 34872
+ lisää koriin
INSSI