haku: @keyword workflow / yhteensä: 18
viite: 5 / 18
Tekijä:Ahvenlampi, Antti
Työn nimi:Scientific calculation on workflows in the domain of systems biology
Tieteellinen laskenta datan käsittelykaaviolla systeemibiologian alalla
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2009
Sivut:56 (+10)      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Tietotekniikan laitos
Oppiaine:Ohjelmistotekniikka   (T-106)
Valvoja:Soisalon-Soininen, Eljas
Ohjaaja:Mettälä, Antti
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark Aalto     | Arkisto
Avainsanat:systems biology
workflow
mathematical language
knowledge sharing
unit conversion
systeemibiologia
datan käsittely
matemaattiset ohjelmointikielet
tietämyksen jako
yksikkömuunnokset
Tiivistelmä (fin): Systeemibiologian tutkimuksessa erilaisista kokeista saadaan mittaus- ja tilastodataa.
Dataan liitetään usein mukaan tietoa siitä mitä on mitattu, missä on mitattu ja milloin mittaus on tehty.
Tätä raakaa tutkimusdataa yleensä jatkokäsitellään tieteellisen datan käsittelykaavioilla tuottaen lopulta tutkimustuloksia.
Datan käsittelykaavioilla tutkimusdatalle voidaan tehdä erilaisia laskenta-, yhdistely- ja muokkaustoimenpiteitä.
Suuressa roolissa tässä käsittelyssä on erilaiset matemaattiset ja tilastotieteelliset laskennat taulukko- ja matriisimuotoiselle datalle.
Tämän diplomityön tuloksena syntyi työkalupaketti, jonka avulla edellä kuvatun mukaista laskentaa pystytään määrittelemään datan käsittelykaavioihin matemaattisen ohjelmointikielen avulla.

Kirjallisuustutkimuksena aluksi esiteltiin datan käsittelykaaviot ja matemaattiset ohjelmointikielet.
Tämän jälkeen mittauksen taustatietojen kuvaukseen käytettyä kieltä tarkasteltiin tietämyksen jakokielenä.
Ja lopuksi vielä tutkittiin tekniikoita automaattisten yksikkömuunnosten tekoon.
Työssä kuvataan työkalupaketin ja yksikkömuunnosjärjestelmän suunnittelu ja toteutus.
Lopuksi työkalupaketin ja yksikkömuunnosjärjestelmän toteutusta arvioidaan.

Arvioinnin perusteella voidaan sanoa, että työkalupaketti on tarpeellinen ja helposti käytettävä, mutta muutamat toteutetut käsittelymenetelmät vaativat liian paljon muistia ja vaativat siten jatkokehittämistä.
Työkalupaketti nähtiin erityisesti sopivan uusien tieteellisten laskentamenetelmien kokeilemiseen ja testaamiseen.
Yksikkömuunnosjärjestelmästä ei ollut merkittävää hyötyä koska sovellusalueella suuri osa laskemisesta tapahtui yksiköttömillä suureilla.
ED:2009-07-14
INSSI tietueen numero: 38056
+ lisää koriin
INSSI