haku: @keyword biomarkkeri / yhteensä: 2
hakutulos-lista
viite: 2 / 2
« edellinen | seuraava »
Tekijä:Laajala, Essi
Työn nimi:Tyypin 1 diabeteksen biomarkkerit ihmisen kokoveren transkriptomissa
Type 1 diabetes biomarkers in human whole blood transcriptome
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2011
Sivut:iv + 72 s. + liitt. 3      Kieli:   fin
Koulu/Laitos/Osasto:Tietojenkäsittelytieteen laitos
Oppiaine:Informaatiotekniikka   (T-61)
Valvoja:Lähdesmäki, Harri
Ohjaaja:Kallionpää, Henna
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje
sulje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark Aalto  920   | Arkisto
Avainsanat:type 1 diabetes mellitus
seroconversion
transcriptomics
biomarker
follow-up study
tyypin 1 diabetes mellitus
serokonversio
transkriptomiikka
biomarkkeri
seurantatutkimus
Tiivistelmä (fin): Tämä diplomityö on osa maailman kattavinta tyypin 1 diabetesta koskevaa geeniekspressiotutkimusta, jonka aineisto on, kerätty 28 tapaus-kontrolliparilta useassa eri aikapisteessä.
Ihmisen kokoveren transkriptomista etsittiin tyypin 1 diabeteksen biomarkkereiksi soveltuvia transkripteja tai transkriptijoukkoja.
Erityisesti patogeneesin varhaisessa vaiheessa havaittavia muutoksia pidettiin kiinnostavina.

Ylös- ja alas säädeltyjä transkripteja kartoitettiin viidessä aikaikkunassa rankituloihin perustuvalla tilastollisella menetelmällä, minkä jälkeen tulokset ryhmiteltiin mm. selvittämällä mielenkiintoisten transkriptien joukossa rikastuneet tunnetut signalointireitit.
Interferonivaste dominoi tuloksia kaikissa aikaikkunoissa.

Tulosten perusteella tyypin 1 diabeteksen patogeneesin kannalta olennaisia muutoksia on mahdollista havaita ihmisen kokoveren transkriptomissa jo ennen serokonversiota.
Joidenkin varhain erilaisesti ekspressoituneiden geenien yhteys tyypin 1 diabeteksen patogeneesiin oli vahvistettu aikaisemmissa julkaisuissa, ja lisäksi luotiin uusia hypoteeseja myöhempää tarkastelua varten.
Tiivistelmä (eng): This master's thesis is a part of a project, which has (to our knowledge) been the most comprehensive analysis of transcriptional changes associated with type 1 diabetes.
The transcriptome-wide data was collected from 28 case-control pairs in several time points, with the purpose to find transcripts or groups of transcripts, which could be used as biomarkers of type 1 diabetes.
Changes that can be perceived in the earliest stages of the pathogenesis were of particular interest.

Up- and down-regulated transcripts were surveyed with a rank product based method in five time windows, after which the results were grouped for example by testing for enriched signalling pathways.
Interferon response dominated the results in all time windows.

Our results suggest that type 1 diabetes pathogenesis is reflected in human whole blood transcriptome already before seroconversion.
Some of these differentially expressed genes have previously been validated as associated with type 1 diabetes.
In addition, new hypotheses were created for further studies.
ED:2011-11-21
INSSI tietueen numero: 42980
+ lisää koriin
« edellinen | seuraava »
INSSI