haku: @supervisor Sá-Correia, Isabel / yhteensä: 2
hakutulos-lista
viite: 1 / 2
« edellinen | seuraava »
Tekijä:Koirala, Bhabuk
Työn nimi:Dynamic modeling and control of the main metabolism in Lactic acid bacteria
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2013
Sivut:62      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Perustieteiden korkeakoulu
Oppiaine:Informaatiotekniikka   (T-61)
Valvoja:Rousu, Juho ; Sa-Correia, Isabel
Ohjaaja:Sousa Costa, Rafael
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje
sulje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark Aalto     | Arkisto
Avainsanat:Lactococcus lactis
dynamic modeling
parameter estimation
convenience kinetics
in vivo NMR data fitting
sensitivity control analysis
Tiivistelmä (eng): Lactic acid bacteria (LAB) are widely used in industrial manufacture of fermented foods and regarded as cell factories for production of pharmaceutical and food products.
Lactococcus lactis, due to its small genome size and simple metabolism, has been considered a model organism for strain design strategies and metabolic engineering.
Metabolic modelling provides a platform to conduct in silico experiments with biotechnological and biomedical applications.

With a fully detailed kinetic model, time-course simulations, response to different input can be predicted and system controllers can be designed.
For L. lactis, the dynamic models for the central carbon metabolism have already been constructed.
However, these models lack our compound of interest and need to be extended.
Provided the topology of pathway and kinetic parameters, a dynamic model that describes the glycolytic pathway in L. lactis is reconstructed using convenience kinetics.

This model is now improved by estimating the parameters using in vivo Nuclear Magnetic Resonance (NMR) data fitting.
Sensitivity analysis was performed in the reconstructed model for acetoin and butanediol production which suggests that down expression of the enzyme levels for lactate dehydrogenase, phosphofructokinase, pyruvate dehydrogenase causes a rise in production of acetoin and 2,3-butanediol.
In addition to these enzyme levels, down expression of acetoin transportase and alcohol dehydrogenase levels accounts for enhanced production of 2,3-butanediol.

The reconstructed model can be used as a basis to design metabolic engineering experiments and also to predict the phenotype of the bacterium under different environmental and genetic conditions.
The model can also serve as a starting point to model other LAB for instance Streptococcus pneumoniae.
ED:2014-01-13
INSSI tietueen numero: 48333
+ lisää koriin
« edellinen | seuraava »
INSSI