haku: @instructor Eerikäinen, Tero / yhteensä: 27
hakutulos-lista
viite: 20 / 27
« edellinen | seuraava »
Tekijä:Wallenius, Janne
Työn nimi:Lactobacillus rhamnosus GG:n geeniekspressiovasteet kasvuympäristön pH:n vaihteluun
Gene expression responses of Lactobacillus rhamnosus GG to pH changes of the growth environment
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2010
Sivut:viii + 72 s. + liitt. 35      Kieli:   fin
Koulu/Laitos/Osasto:Elektroniikan, tietoliikenteen ja automaation tiedekunta
Oppiaine:Bioprosessitekniikka   (Kem-70)
Valvoja:Leisola, Matti
Ohjaaja:Eerikäinen, Tero ; Pitkänen, Juha-Pekka
Elektroninen julkaisu: http://urn.fi/URN:NBN:fi:aalto-201203131500
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje
sulje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark Aalto  1547   | Arkisto
Avainsanat:Gene expression
geeniekpsressio
pH
Lactobacillus rhamnosus GG
qPCR
TRAC
atpA
aldB
cfa
groEL
hrcA
pstS
ldhD
Tiivistelmä (fin): Monitoroimalla organismin geeniekspressiota voidaan saada hyödyllistä informaatiota fysiologiasta bioprosessikasvatuksen eri vaiheissa.
Tässä työssä on tutkittu kirjallisuudessa aiemmin mainittujen pH-stressiin liittyvien geenien atpA, aldB, cfa, groEL, hrcA ja pstS ekspressoitumista suhteellisen geeniekspression menetelmällä käyttäen vertailugeeninä ldhD:tä.
Ekspressiomittaukset tehtiin käyttäen qPCR- ja TRAC-menetelmää.
Tutkittuna organismina oli probioottina tunnettu Lactobacillus rhamnosus GG (LGG).
Teollisen kasvatuksen pH:n säädössä esiintyviä emäsgradientteja sekä lämpötilagradientteja simuloitiin scale-down-menetelmällä.
Lisäksi tutkittiin laboratorioravintoalustan ja teollisen ravintoalustan välisiä eroja panoskasvatuksilla.

Scale-down-kokeissa havaittiin geenien groEL, hrcA ja atpA antavan vasteita lämpötilan ja pH:n muutoksiin. pstS-geenin ekspressio kasvoi lähes lineaarisesti kemostaattikokeissa tulppavirtausreaktoriin aiheutetun emäsgradientin kasvaessa.
Työssä tutkittujen geenien ekspressioiden yksittäiset korrelaatiot kemostaattikokeiden näytteille tehtyjen happostressi- ja pakastussäilyvyyksien välillä olivat vähäisiä.
Panoskasvatuksista tehtyjen geeniekspressiomittausten perusteella erilaisilla kasvualustoilla näyttäisi olevan vaikutusta tutkittujen geenien ekspressioon.
Teollisella alustalla ekspressioiden suhteelliset muutokset eri kasvuvaiheiden välillä olivat pienempiä, mutta vertailugeeniin verratut ekspressiot olivat pääsääntöisesti suurempia kuin laboratorioalustalla.
Tiivistelmä (eng): Monitoring organism's gene expression can provide useful information on it's physiology in different phases of cultivation.
In this work expression of pH stress related genes found from the literature (atpA, aldB, cfa, groEL, hrcA and pstS) were studied as a relative gene expression study using ldhD as a reference gene.
Expression measurements were carried out using qPCR and TRAC methods.
Study organism was Lactobacillus rhamnosus GG, a renowned probiotic.
Base gradients caused by pH control in an industrial process and temperature gradients were simulated with a scale-down method.
A pH gradient was created in a plug flow reactor.
Furthermore, differences between laboratory cultivation medium and industrial cultivation medium were studied with batch cultivations.
In these cultivations the set point of pH control was oscillated.

In the scale-down experiments the responses of groEL, hrcA and atpA genes to temperature and pH changes were studied.
The expression of pstS gene was induced almost linearly in the chemostat cultivation experiments when base gradient in plug flow reactor was increased.
There was rather low correlations between the expressions of studied genes and surviving from acid stress test or freeze stability test, which were carried out from the samples of the chemostat cultivation experiments.
Based on gene expression measurements from the batch cultivations it seems that the type of the cultivation medium affects expressions of the studied genes.
In case of the industrial cultivation medium relative changes in gene expressions were less between different growth phases but expressions related to the reference gene were mainly higher compared to the laboratory medium.
ED:2010-08-19
INSSI tietueen numero: 40188
+ lisää koriin
« edellinen | seuraava »
INSSI