haku: @keyword Bayesian analysis / yhteensä: 4
viite: 2 / 4
Tekijä: | Golumbeanu, Monica |
Työn nimi: | Statistical analysis of PAR-CLIP data |
Julkaisutyyppi: | Diplomityö |
Julkaisuvuosi: | 2013 |
Sivut: | 51 Kieli: eng |
Koulu/Laitos/Osasto: | Perustieteiden korkeakoulu |
Oppiaine: | Informaatiotekniikka (T-61) |
Valvoja: | Lähdesmäki, Harri ; Aurell, Erik ; Beerenwinkel, Niko |
Ohjaaja: | Mohammadi, Pejman |
OEVS: | Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossaOppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa. Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/ Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.
Kirjautuminen asiakaskoneille
Opinnäytteen avaaminen
Opinnäytteen lukeminen
Opinnäytteen tulostus
|
Sijainti: | P1 Ark Aalto | Arkisto |
Avainsanat: | statistical modeling PAR-CLIP RNA-binding proteins Bayesian analysis |
Tiivistelmä (eng): | From creation to its degradation, the RNA molecule is the action field of many binding proteins with different roles in regulation and RNA metabolism. Since these proteins are involved in a large number of processes, a variety of diseases are related to abnormalities occurring within the binding mechanisms. One of the experimental methods for detecting the binding sites of these proteins is PAR-CLIP built on the next generation sequencing technology. Due to its size and intrinsic noise, PAR-CLIP data analysis requires appropriate pre-processing and thorough statistical analysis. The present work has two main goals. First, to develop a modular pipeline for pre-processing PAR-CLIP data and extracting necessary signals for further analysis. Second, to devise a novel statistical model in order to carry out inference about presence of protein binding sites based on the Signals extracted in the pre-processing step. |
ED: | 2013-09-25 |
INSSI tietueen numero: 47249
+ lisää koriin
INSSI