haku: @keyword proteomiikka / yhteensä: 5
viite: 3 / 5
Tekijä:Simola, Juhani
Työn nimi:Protein identification by tandem mass spectrometry and sequence database search
Proteiinien tunnistus tandem-massaspektrometrian ja sekvenssitietokantahaun avulla
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2004
Sivut:69+11      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Tietotekniikan osasto
Oppiaine:Informaatiotekniikka   (T-122)
Valvoja:Hollmén, Jaakko
Ohjaaja:Peltoniemi, Hannu
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark Aalto     | Arkisto
Avainsanat:proteomics
protein identification
tandem mass spectrometry
proteomiikka
proteiinin tunnistus
tandem-massaspektrometria
Tiivistelmä (fin): Viime vuosina proteomiikan tutkimus on kasvanut räjähdysmäisesti.
Tärkeimmät tähän vaikuttaneet tekijät ovat genominkartoitusprojektien valmistuminen sekä biomolekyyleille sopivien massaspektrometriamenetelmien kehitys.
Massaspektrometrian avulla on mahdollista käsitellä proteiininäytteitä nopeasti ja tarkasti.
Spektrien tulkinta vaatii ammattitaitoa sekä tarkoitukseen tehtyjen tietokoneohjelmien käyttöä.

Tämä diplomityö kuvaa proteiinien massaspektrometrista tunnistusta keskittyen massaspektrien tulkintamenetelmiin.
Työtä varten kirjoitettiin ohjelma proteiinien tunnistusta massaspektrometrian avulla varten.
Ohjelmaa varten kehitettiin uusi todennak6isyyteen perustuva pisteytysfunktio joka mittaa yhdenkaltaisuutta aminohapposekvenssin ja mitatun massaspektrin välillä.
Tiivistelmä (eng): During the last years, the proteome research has grown explosively.
The most important contributing factors to this are the completion of genome sequencing projects and the introduction of mass spectrometry methods suitable for biomolecules.
Mass spectrometry allows rapid and accurate processing of protein samples.
It requires skill and specialized computer software to interpret the results of mass spectrometry.

This thesis describes identifying proteins by mass spectrometry, concentrating on interpreting the mass spectra.
In the work, a program for identifying proteins by mass spectrometry was written.
A new probability-based matching function, measuring the homology between an amino acid sequence and a measured mass spectrum, is proposed.
ED:2004-11-26
INSSI tietueen numero: 26522
+ lisää koriin
INSSI