haku: @keyword proteiini / yhteensä: 5
hakutulos-lista
viite: 5 / 5
« edellinen | seuraava »
Tekijä:Lahdenperä, Maria
Työn nimi:A Tool for predicting protein-protein interactions through cross-species comparisons
Sovellus proteiinien välisten vuorovaikutusten ennustamiseksi vertailevaa genomiikkaa käyttäen
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2005
Sivut:78 s. + liitt.      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Automaatio- ja systeemitekniikan osasto
Oppiaine:Laskennallinen tekniikka   (S-114)
Valvoja:Kaski, Kimmo
Ohjaaja:Mäkelä, Tomi
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje
sulje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark TKK  6697   | Arkisto
Avainsanat:protein-protein interaction
prediction
predicted interactome
interolog
comparative genomics
bioinformatics
systems biology
proteiini-proteiini interaktio
proteiini
vuorovaikutus
ennustaminen
vertaileva genomiikka
bioinformatiikka
laskennallinen systeemibiologia
Tiivistelmä (fin): Proteiinien keskinäisten vuorovaikutusten selvittäminen on tärkeää biologisten prosessien ymmärtämiseksi.
Laajamittainen koko genomista tuotettavien proteiinien selvitys alkoi kymmenisen vuotta sitten ensimmäisten sekvenointiprojektien valmistuttua.
Proteiinien suoria vuorovaikutuksia keskenään koko proteomin laajuudelta on tutkittu vasta vuoden 2000 jälkeen, jolloin ensimmäiset tulokset hiivan (S. cerevisiae) osalta julkaistiin.
Tällä hetkellä on olemassa vastaavaa laajamittaista aineistoa myös banaanikärpäsestä (D. melanogaster) ja sukkulamadosta (C. elegans).
Ihmisen ja muiden nisäkkäiden osalta proteiinien välisistä vuorovaikutuksista ei ole vastaavaa laajamittaista aineistoa.

Työssä on kehitetty sovellus, jolla voidaan ennustaa proteiinien välisiä vuorovaikutuksia malliorganismeista olevaa laajamittaista aineistoa käyttäen ihmisen, hiiren ja malliorganismien proteiineille.
Tällainen tietämyksen siirto voidaan tehdä, koska on mahdollista perustella, että malliorganismeissa toisiinsa sitoutuville proteiineille löytyy vastineet l. ortologit muissa lajeissa, kuten ihmisessä.
Näin saatua hypoteettista interaktiotietoa voidaan käyttää biologisten tai bioinformatiivisten tutkimusten pohjana tai priorisoinnin tukena.

Sovellus on toteutettu web-pohjaisena ja se sisältää toteutukset sekä käyttöliittymälle että hakualgoritmille.
Työssä käytetty tutkimusaineisto, sekä proteiinien vuorovaikutuksista, että ortologeista on kerätty julkisista tietokannoista.
ED:2005-05-09
INSSI tietueen numero: 28772
+ lisää koriin
« edellinen | seuraava »
INSSI