haku: @keyword nanoteknologia / yhteensä: 7
hakutulos-lista
viite: 6 / 7
« edellinen | seuraava »
Tekijä:Anttalainen, Sini
Työn nimi:Interactions between fullerols and DNA/RNA oligonucleotides
Fullerolien ja DNA/RNA oligonukleotidien väliset vuorovaikutukset
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2009
Sivut:ix + 54      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Informaatio- ja luonnontieteiden tiedekunta
Koulutusohjelma:Teknillisen fysiikan ja matematiikan tutkinto-ohjelma
Oppiaine:Lääketieteellinen tekniikka   (Tfy-99)
Valvoja:Koskelainen, Ari
Ohjaaja:Salonen, Emppu
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje
sulje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark T80     | Arkisto
Avainsanat:fullerene
fullerol
nanotechnology
DNA
RNA
molecular dynamics
fullereeni
fulleroli
nanoteknologia
DNA
RNA
molekyylidynamiikka
Tiivistelmä (fin): Fullereenit ovat pallomaisia tai ellipsin muotoisia nanokokoisia molekyylejä, jotka sisältävät ainoastaan hiiliatomeja.
Tavallisimmin nanoteknologian tutkimuksissa käytetty fullereeni on C60, joka on täysin veteen liukenematon molekyyli.
Fullereenin pinnalle voidaan kiinnittää hydrofiilisiä funktionaalisia ryhmiä, kuten -OH, -COOH or -NH2 lisäämään vesiliukoisuutta.
Tässä työssä käytämme vesiliukoista fullereenijohdannaista fullerolia C60(OH)20.

Tämän työn tarkoituksena on tutkia vesiliukoisen nanopartikkelin fullerolin ja oligonukleotidien, DNA ja RNA, välisiä vuorovaikutuksia molekyylidynamiikan menetelmää käyttäen.
Fullerolien vaikutukset oligonukleotideihin on tärkeää saada selville, koska fullerolia suunnitellaan käytettäväksi nanolääketieteessä, esimerkiksi lääkkeiden kuljetuksessa.

40 ns pituiset molekyylidynamiikkasimulaatiot ajettiin kaksi- ja yksijuosteiselle DNA:lle sekä kahdelle eri nukleotidijärjestyksen omaavalle yksijuosteiselle RNA:lle.
Jokaisessa simulaatiosysteemissä oligonukleotidejä simuloitiin yhden tai neljän fullerolin kanssa.
Tarkastelimme simulaatioista lähinnä viimeistä 10 ns:a, koska 30 ns:iin mennessä fullerolit olivat löytäneet paikkansa oligonukleotidiketjussa.

Tässä työssä tutkittiin fullerolien tarkkoja sitoutumiskohtia oligonukleotidiketjussa, ja kuinka fullerolit vaikuttavat ketjun rakenteeseen.
Tutkittiin myös ovatko fullerolit mieluummin oligonukleotidin emästen vai fosfaattiryhmien läheisyydessä, ja suosivatko fullerolit joitain emäksiä enemmän kuin toisia.
Tiivistelmä (eng): Fullerenes are a class of spherical or ellipsoidal nanosized molecules consisting exclusively of carbon atoms.
The most common type of fullerene in nanotechnology research is C60, which is totally insoluble in water.
To increase the solubility of C60 hydrophilic functional groups such as -OH, -COOH or -NH2 can be attached on the fullerene surface.
In this work we use a water soluble fullerene derivative, fullerol C60(OH)20.

The purpose of this work is to study the interactions between fullerol and oligonucleotides, DNA and RNA, using molecular dynamics simulation method.
An understanding of the effects that fullerols have on oligonucleotides is required because fullerols are tested to be used in nanomedicine, for example drug delivery. 40 ns long atomistic molecular dynamics simulations were carried out for double- and single-stranded DNA, and two different nucleotide sequences of single-stranded RNA.
In each system oligonucleotides with a single and four fullerols were simulated.
In the results only the last 10 ns time period was analyzed because by that time the fullerols had found their place in the oligonucleotide chain.

The exact locations of fullerols in the oligonucleotide chain and how the fullerois affect to the structure of the chain were studied in this work.
It was also studied whether fullerois are more attracted by the phosphate groups or the bases of the oligonucleotides and whether the fullerois favour some bases over the others.
ED:2009-05-13
INSSI tietueen numero: 37404
+ lisää koriin
« edellinen | seuraava »
INSSI