haku: @keyword geeniekspressio / yhteensä: 8
hakutulos-lista
viite: 8 / 8
« edellinen | seuraava »
Tekijä:Pykälä, Heli
Työn nimi:Dynamic modelling of very high dimensional data - Application in gene expression
Erittäin korkeaulotteisen datan dynaaminen mallitus - Sovellus geeniekspressioon
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2005
Sivut:56 s. + liitt.      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Automaatio- ja systeemitekniikan osasto
Oppiaine:Systeemitekniikka   (AS-74)
Valvoja:Hyötyniemi, Heikki
Ohjaaja:Haavisto, Olli
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje
sulje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark TKK  6640   | Arkisto
Avainsanat:dynamic modelling
subspace identification
gene expression
DNA microarray
dynaaminen mallitus
aliavaruusidentifiointi
geeniekspressio
DNA-mikrosiru
Tiivistelmä (fin):Perinteiset mallitusalgoritmit eivät suoriudu tehtävästään, jos datan dimensio on suurempi kuin näytteiden määrä (erittäin korkeaulotteinen data).
Tällaiseen tilanteeseen törmätään muunmuassa geeniekspression mallituksessa.
DNA-mikrosirutekniikan avulla on mahdollista määrittää koko genomin aktiivisuus samalla aikahetkellä, mikä tuottaa tuhansia aktiivisuusarvoja.
Mittausten kalleudesta johtuen näytteitä on saatavilla korkeintaan joistain sadoista aikapisteistä.

Jotta tällaisen datan dynaaminen mallittaminen olisi mahdollista, datan dimensiota on pienennettävä jollain redusointitekniikalla.
Perinteisesti geeniekspression mallituksessa dimensiota on redusoitu ennen mallitusta esimerkiksi jättämällä osa geeneistä tarkastelun ulkopuolelle.

Tässä työssä käytetään mallitukseen aliavaruusidentifiointia, jolla monimuuttujadatasta voidaan laskea suoraan matalaulotteinen lineaarinen tilamalli.
Menetelmä muokataan soveltuvaksi erittäin korkeaulotteisen datan mallitukseen ja muokatun algoritmin toimivuutta arvioidaan simuloidun datan avulla.
Lopuksi menetelmää sovelletaan myös geeniekspressio-datan mallitukseen.

Työssä havaitaan, että menetelmä on sovellettavissa erittäin korkeaulotteisen datan mallitukseen, joskin siinä on joitakin puutteita.
Tulokset geeniekspression mallituksessa ovat vertailukelpoisia kirjallisuudessa esitettyjen menetelmien kanssa huolimatta saatavilla olevan datan huonolaatuisuudesta.
ED:2005-11-22
INSSI tietueen numero: 29988
+ lisää koriin
« edellinen | seuraava »
INSSI