haku: @keyword data visualization / yhteensä: 9
hakutulos-lista
viite: 8 / 9
« edellinen | seuraava »
Tekijä:Taanila, Erkki
Työn nimi:Interactive Workbench for Visualization and Processing of Systems Biological Data
Ohjelmisto systeemibiologisen datan vuorovaikutteiseen havainnollistamiseen ja käsittelyyn
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2005
Sivut:71      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Tietotekniikan osasto
Oppiaine:Tietojenkäsittelyoppi   (T-76)
Valvoja:Sulonen, Reijo
Ohjaaja:Pellikka, Tarmo
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje
sulje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark T80     | Arkisto
Avainsanat:systems biology
interactive
data visualization
multidimensional data
java
software architecture
implementation
evaluation
systeemibiologia
vuorovaikutteisuus
datan visualisointi
moniulotteinen data
java
ohjelmistoarkkitehtuuri
toteutus
arviointi
Tiivistelmä (fin):Interactive Workbench (IAW) on ohjelmisto systeemibiologisen datan käsittelyyn ja havainnollistamiseen.
Se on osa laajempaa systeemibiologista ohjelmistokokonaisuutta nimeltään Biomedical System (BMS).
Tämä diplomityö esittelee IAW:n suunnittelun, toteutuksen ja lopputuloksen arvioinnin.

Systeemibiologia on suhteellisen uusi tieteenala.
Se tähtää elollisen olennon, kuten ihmisen, mallintamiseen systeemitasolla.
Mallintaminen systeemitasolla tarkoittaa eksaktia mallintamista, vastaavalla tavalla kuin piirikaaviot mallintavat sähkölaitteen toimintaa.
Elollisen olennon systeemitason toiminnallisuuden ymmärtämiseen ei ole olemassa suoraa ja yksiselitteistä tapaa.
Malli pitää muodostaa epäsuorasti havainnoimalla ja mittaamalla olennon käyttäytymistä ja sen reagoimista annettuihin ärsykkeisiin.
Käytännössä tämä tarkoittaa kvantitatiivisen datan tuottamista ja analysointia.
Tämä data voi olla mittausdataa, simuloitua dataa tai näistä yhdistelemällä tai tiettyjä asioita poimimalla saatua dataa.
Tämä data on luonteeltaan moniulotteista eli jokaiseen numeeriseen arvoon liittyy useita määreitä, joita myös datan ulottuvuuksiksi kutsutaan.

Monessa tapauksessa tällaisen datan tulkinta eli datan sisältämän informaation löytäminen voi olla vaikeaa tutkijalle.
Tämä voi johtua esimerkiksi datan suuresta määrästä tai datan esitysmuodosta.
Datan esittäminen graafisessa muodossa ja datan muokkaaminen esimerkiksi vähentämällä datan ulottuvuuksia voi auttaa pääsemään käsiksi datan informaatiosisältöön.
Juuri tätä varten IAW on tarkoitettu.

Työn ensimmäinen osa on kirjallisuustutkimus, jossa pyritään löytämään IAW:lle ja sen ohjelmistoarkkitehtuurille hyödyllisiä tekniikoita ja ohjelmistosuunnitteluperiaatteita.
Lisäksi kirjallisuustutkimuksen tavoitteena on löytää ratkaisuja, joihin tätä ohjelmaa voi verrata.
Seuraava osa työstä esittelee yllä mainitun systeemibiologisen ohjelmistokokonaisuuden ja IAW:n osuuden siinä.

Seuraavaksi esitellään vaatimukset IAW:lle sekä ohjelman tekninen määrittely ja ohjelmistoarkkitehtuuri.
Näiden jälkeen on esitetty IAW:n arviointi.

Arvioinnin perusteella voidaan sanoa, että IAW toimii systeemibiologisen datan käsittelyyn sekä graafiseen havainnollistamiseen.
Verrokkiratkaisut toteuttavat kukin tietyn osan IAW:n toiminnallisuudesta.
On mahdollista, että verrokkiratkaisuja yhdistelemällä voitaisiin saavuttaa samanlainen tai parempi toiminnallisuus kuin IAW:n tarjoama.
Tämä olisi yksi mielenkiintoinen jatkotutkimuksen kohde.
IAW:n suorituskyky on riittävä analysoimaan niin suuria datakokonaisuuksia, että analyysillä on käytännön merkitystä systeemibiologiselle tutkijalle.
IAW:n tarjoama oleellinen hyöty on datan käsittelyn sekä graafisen havainnollistamisen yhdistäminen samaan ohjelmaan.
ED:2005-07-01
INSSI tietueen numero: 28976
+ lisää koriin
« edellinen | seuraava »
INSSI