haku: @instructor Heikkonen, Jukka / yhteensä: 8
viite: 6 / 8
Tekijä:Nieminen, Tapio
Työn nimi:Reconstruction Methods in Cryo Electron Tomography
Rekonstruktiomenetelmät kryoelektronitomografiassa
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2005
Sivut:61      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Tietotekniikan osasto
Oppiaine:Laskennallinen tekniikka   (S-114)
Valvoja:Kaski, Kimmo
Ohjaaja:Heikkonen, Jukka
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark Aalto     | Arkisto
Avainsanat:electron tomography
three-dimensional reconstruction
cryo electron microscopy
elektronitomografia
kolmiulotteinen rekonstruktio
kryoelektronimikroskopia
Tiivistelmä (fin): Tämän diplomityön aiheena oli kolmiulotteinen rekonstruktio kryoelektronitomografiassa.
Elektronitomografiaa voidaan käyttää biotieteissä soluelinten ja suurten makromolekyylien kolmiulotteisen rakenteen laskemiseen joukosta kaksiulotteisia elektronimikroskopiakuvia.
Menetelmä on analoginen röntgentomografian kanssa.
Kryoelektronimikroskopia pyrkii vähentämään biologisille näytteille tapahtuvia vaurioita, mutta tämän vastapainona kuvat ovat kohinaisia ja niiden kontrasti on alhainen.
Alhainen kontrasti ja signaalikohinasuhde vaikeuttavat 3D-rekonstruktiota.

Työssä toteutettiin multiplikatiivinen algebrallinen rekonstruktiotekniikka (MART) kolmiulotteisen rekonstruktion laskemista varten.
MART on alun perin 1970-luvulla tietokonetomografiaa varten kehitetty algoritmi ja tässä työssä tutkittiin sen soveltamista kryoelektronitomografiaan.
Algoritmia kokeiltiin synteettisellä ja todellisella datalla ja verrattiin alan standardialgoritmiin, painotettuun takaisinprojektioon, sekä vähemmän tunnettuun maksimientropiamenetelmään.
MART-algoritmin tulokset sijaitsivat pääosin näiden kahden algoritmin välissä sekä suoritusajan että rekonstruktion laadun suhteen.
ED:2005-11-11
INSSI tietueen numero: 29974
+ lisää koriin
INSSI