haku: @supervisor Puolamäki, Kai / yhteensä: 62
hakutulos-lista
viite: 4 / 62
« edellinen | seuraava »
Tekijä:Pettersson, Ville
Työn nimi:Searching for evolvable and nonevolvable functional relationships between genes
Geenien välisten evolutiivisten ja eievolutiivisten funktionaalisten riippuvuuksien etsiminen
Julkaisutyyppi:Diplomityö
Julkaisuvuosi:2010
Sivut:ix + 63      Kieli:   eng
Koulu/Laitos/Osasto:Informaatio- ja luonnontieteiden tiedekunta
Oppiaine:Informaatiotekniikka   (T-61)
Valvoja:Puolamäki, Kai
Ohjaaja:Ojala, Markus ; Hanhijärvi, Sami
OEVS:
Sähköinen arkistokappale on luettavissa Aalto Thesis Databasen kautta.
Ohje
sulje

Digitaalisten opinnäytteiden lukeminen Aalto-yliopiston Harald Herlin -oppimiskeskuksen suljetussa verkossa

Oppimiskeskuksen suljetussa verkossa voi lukea sellaisia digitaalisia ja digitoituja opinnäytteitä, joille ei ole saatu julkaisulupaa avoimessa verkossa.

Oppimiskeskuksen yhteystiedot ja aukioloajat: https://learningcentre.aalto.fi/fi/harald-herlin-oppimiskeskus/

Opinnäytteitä voi lukea Oppimiskeskuksen asiakaskoneilla, joita löytyy kaikista kerroksista.

Kirjautuminen asiakaskoneille

  • Aalto-yliopistolaiset kirjautuvat asiakaskoneille Aalto-tunnuksella ja salasanalla.
  • Muut asiakkaat kirjautuvat asiakaskoneille yhteistunnuksilla.

Opinnäytteen avaaminen

  • Asiakaskoneiden työpöydältä löytyy kuvake:

    Aalto Thesis Database

  • Kuvaketta klikkaamalla pääset hakemaan ja avaamaan etsimäsi opinnäytteen Aaltodoc-tietokannasta. Opinnäytetiedosto löytyy klikkaamalla viitetietojen OEV- tai OEVS-kentän linkkiä.

Opinnäytteen lukeminen

  • Opinnäytettä voi lukea asiakaskoneen ruudulta tai sen voi tulostaa paperille.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi tallentaa muistitikulle tai lähettää sähköpostilla.
  • Opinnäytetiedoston sisältöä ei voi kopioida.
  • Opinnäytetiedostoa ei voi muokata.

Opinnäytteen tulostus

  • Opinnäytteen voi tulostaa itselleen henkilökohtaiseen opiskelu- ja tutkimuskäyttöön.
  • Aalto-yliopiston opiskelijat ja henkilökunta voivat tulostaa mustavalkotulosteita Oppimiskeskuksen SecurePrint-laitteille, kun tietokoneelle kirjaudutaan omilla Aalto-tunnuksilla. Väritulostus on mahdollista asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Väritulostaminen on maksullista Aalto-yliopiston opiskelijoille ja henkilökunnalle.
  • Ulkopuoliset asiakkaat voivat tulostaa mustavalko- ja väritulosteita Oppimiskeskuksen asiakaspalvelupisteen tulostimelle u90203-psc3. Tulostaminen on maksullista.
Sijainti:P1 Ark Aalto  19   | Arkisto
Avainsanat:evolvability
computational learning theory
evolution
gene-expression
evolutiivisuus
evoluutio
geeniekspressio
koneoppimisteoria
Tiivistelmä (fin): Darwinin evoluutioteoria selittää miten eri lajit syntyvät ja kehittyvät luonnonvalinnan avulla.
Vaikka luonnonvalinta voi kehittää suhteellisen monimutkaisia rakenteita yksinkertaisemmista esi-isistä, on olemassa rajoitteita sille mitkä rakenteet voivat kehittyä ja mitkä eivät.

Artikkelissa "Evolvability" Leslie G.
Valiant tutkii luonnonvalinnan rajoitteita matemaattisesta näkökulmasta.
Hän määrittelee ns. funktioiden evolutiivisuuden käsitteen, ja osoittaa että Boolen konjunktio (JA) ja disjunktio (TAI) funktioilla on tämä ominaisuus, eli ne voivat kehittyä artikkelin evoluution määritelmän mukaan, kun taas Boolen pariteettifunktio (XOR) ei voi kehittyä.

Tässä diplomityössä yritämme selvittää missä määrin nämä tulokset ovat sovellettavissa biologisiin eliöihin.
Tutkimme löytyykö eliöistä mitatusta geeniekspressiodatastageenien väliltä Boolen pariteetti, konjunktio ja disjunktiofunktioita.

Tulokset osoittavat että funktionaaliset riippuvuudet geeniekspressiodatassa vastaavat karkeasti Valiantin artikkelin johtopäätöksiä; tilastollisesti merkitseviä konjunktioja disjunktiofunktioita löytyy runsaasti, mutta pariteettifunktiot ovat harvinaisempia.
Tästä voidaan päätellä että Valiantin evolutiivisuuden määritelmä voi olla hyödyllinen työkalu eliöiden ominaisuuksien tutkimiseen evoluution näkökulmasta ja lisätutkimuksen arvoinen.
Tiivistelmä (eng): The well known theory of evolution by Darwin explains how different species arise and evolve through the process of natural selection.
Although natural selection can produce relatively complicated structures from simpler ancestors, there are limits to which structures can evolve and which cannot.

In the article "Evolvability" Leslie G.
Valiant studies the limits of natural selection from a mathematical point of view.
He defines the concept of evolvability of functions, and shows that Boolean conjunction (AND) and disjunction (OR) functions are evolvable by the definition given in the article, whereas Boolean parity functions (XOR) are not evolvable.

In this Master's Thesis we test if Valiant's theories are applicable to biological organisms.
Namely, we study whether there is evidence for the existence of Boolean conjunction and disjunction functions and the nonexistence of Boolean parity functions in real life gene-expression data.

The results show that functional relationships in gene-expression data roughly follow the evolvability results of Valiant's article, i.e., statistically significant conjunction and disjunction functions are abundant and parity functions are more rare.
We conclude that Valiant's definition of evolvability can be a useful tool in studying the evolutionary properties of real life organisms and worth further research.
ED:2010-11-22
INSSI tietueen numero: 41342
+ lisää koriin
« edellinen | seuraava »
INSSI