search query: @author Ollila, Samuli / total: 1
reference: 1 / 1
« previous | next »
Author: | Ollila, Samuli |
Title: | Lateral pressure profile calculations of lipid membranes from atomic scale molecular dynamics simulations |
Lipidikalvojen lateraalisen paineen laskeminen atomitason molekyylidynamiikkaa käyttäen | |
Publication type: | Master's thesis |
Publication year: | 2006 |
Pages: | 64 Language: eng |
Department/School: | Teknillisen fysiikan ja matematiikan osasto |
Main subject: | Fysiikka (Tfy-3) |
Supervisor: | Ala-Nissilä, Tapio |
Instructor: | Hyvönen, Marja ; Vattulainen, Ilpo |
OEVS: | Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning CentreIn the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network. The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/ You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.
Logging on to the customer computers
Opening a thesis
Reading the thesis
Printing the thesis
|
Location: | P1 Ark TF80 | Archive |
Keywords: | lateral pressure profile lipid bilayer cell membrane molecular dynamics simulations polyunsaturation lateraalinen painejakauma lipidikaksoiskerros solukalvo molekyylidynamiikkamenetelmä monityydyttymättömät rasvat |
Abstract (fin): | Muutaman nanometrin paksuiset solukalvot sisältävät useita erilaisia molekyylejä (esim. rasvoja, proteiineja ja sokereita). Solukalvon perusrakenteen muodostaa lipidimolekyyleistä muodostuva kaksoiskalvo, mutta funktionaaliset ominaisuudet ovat pääasiassa proteiinien säätelemiä. Proteiinien funktionaalisuuden on kuitenkin huomattu riippuvan ympäristön lipidimolekyyleistä, joten myös puhtaan solukalvokerroksen ominaisuudet saattavat olla funktionaalisesti merkittäviä. Vielä ei kuitenkaan tiedetä miksi ja miten ympärillä olevat lipidit vaikuttavat proteiinien toimintaan. 1990-luvun lopussa esitetyn hypoteesin mukaan painejakauman muutokset lipidikaksoiskerroksessa saattavat aiheuttaa muutoksia proteiinien toiminnassa. Tämän hypoteesin testaus on kuitenkin hankalaa, koska paine-eroja pienien etäisyyksien (~10-9 m) välillä ei pystytä vielä kokeellisesti mittaamaan ja paikallisen paineen määritteleminen teoreettisesti näillä etäisyyksillä on hankalaa. Painejakauma kaksoiskerroksen sisällä on kiinnostava myös yleisemmällä tasolla, koska se yhdistää mikroskooppiset kaksoiskerroksen ominaisuudet kalvon jatkumo-ominaisuuksiin. Tässä työssä on kehitetty menetelmä painejakauman laskemiseksi lipidikaksoiskerroksen sisällä käyttäen atomitason molekyylidynamiikkamenetelmää. Myös kaksoissidosten vaikutusta painejakaumaan tutkittiin ja havaittiin, että kaksoissidokset pienentävät painetta kaksoiskerroksen sisällä, mikä saattaa selittää havaitun kaksoissidosten vaikutuksen kalvoproteiinien toimintaan. |
ED: | 2006-09-27 |
INSSI record number: 32419
+ add basket
« previous | next »
INSSI