search query: @keyword speech / total: 10
reference: 3 / 10
Author: | Koistinen, Olli-Pekka |
Title: | Bayesian Classification of fMRI Patterns for Natural Audiovisual Stimuli Using Sparsity Promoting Laplace Priors |
Luonnollisiin audiovisuaalisiin ärsykkeisiin liittyvän fMRI-aktivaation bayesilainen luokittelu harvoja ratkaisuja suosivia Laplace-prioreja käyttäen | |
Publication type: | Master's thesis |
Publication year: | 2012 |
Pages: | [11] + 69 Language: eng |
Department/School: | Lääketieteellisen tekniikan ja laskennallisen tieteen laitos |
Main subject: | Laskennallinen tekniikka (S-114) |
Supervisor: | Lampinen, Jouko |
Instructor: | Jylänki, Pasi ; Vehtari, Aki |
Electronic version URL: | http://urn.fi/URN:NBN:fi:aalto-201210043223 |
OEVS: | Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning CentreIn the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network. The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/ You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.
Logging on to the customer computers
Opening a thesis
Reading the thesis
Printing the thesis
|
Location: | P1 Ark Aalto 878 | Archive |
Keywords: | audiovisual auditory cortex automatic relevance determination Bayesian classification expectation propagation fMRI Laplace prior music speech audiovisuaalinen bayesilainen fMRI kuuloaivokuori Laplace-priori luokittelu musiikki puhe |
Abstract (eng): | Bayesian linear binary classification models with sparsity promoting Laplace priors were applied to discriminate fMRI patterns related to natural auditory and audiovisual speech and music stimuli. The region of interest comprised the auditory cortex and some surrounding regions related to auditory processing. Truly sparse posterior mean solutions for the classifier weights were obtained by implementing an automatic relevance determination method using expectation propagation (ARDEP). In ARDEP, the Laplace prior was decomposed into a Gaussian scale mixture, and these scales were optimised by maximising their marginal posterior density. ARDEP was also compared to two other methods, which integrated approximately over the original Laplace prior: LAEP approximated the posterior as well by expectation propagation, whereas MCMC used a Markov chain Monte Carlo simulation method implemented by Gibbs sampling. The resulting brain maps were consistent with previous studies for simpler stimuli and suggested that the proposed model is also able to reveal additional information about activation patterns related to natural audiovisual stimuli. The predictive performance of the model was significantly above chance level for all approximate inference methods. Regardless of intensive pruning of features, ARDEP was able to describe all of the most discriminative brain regions obtained by LAEP and MCMC. However, ARDEP lost the more specific shape of the regions by representing them as one or more smaller spots, removing also some relevant features. |
Abstract (fin): | Bayesilaisia lineaarisia binääriluokittelumalleja ja harvoja ratkaisuja suosivia Laplace- prioreja sovellettiin erottelemaan luonnollisiin auditorisiin ja audiovisuaalisiin puhe- ja musiikkiärsykkeisiin liittyvää fMRI-aktivaatiota kuuloaivokuorella ja sitä ympäröivillä auditoriseen prosessointiin liittyvillä alueilla. Absoluuttisen harvoja posteriorisia odotusarvoratkaisuja luokittimien painoille saatiin expectation propagation -algoritmin avulla toteutetulla automatic relevance determination -menetelmällä (ARDEP). ARDEP-menetelmässä hyödynnettiin Laplace-priorin gaussista skaalahajotelmaa, jonka skaalaparametrit optimoitiin maksimoimalla niiden marginaalinen posterioritiheys. Menetelmää verrattiin myös kahteen muuhun menetelmään, jotka integroivat approksimatiivisesti alkuperäisen Laplace-priorin yli: LAEP approksimoi posteriorijakaumaa niin ikään expectation propagation -algoritmin avulla, kun taas MCMC käytti Gibbs -poiminnalla toteutettua Markovin ketju Monte Carlo -simulaatiomenetelmää. Tuloksena saadut aivokartat olivat linjassa aikaisempien, yksinkertaisemmilla ärsykkeillä saatujen tutkimustulosten kanssa, ja niiden perusteella bayesilaisten luokittelumallien avulla on mahdollista saada myös uudenlaista tietoa siitä, miten luonnollisia audiovisuaalisia ärsykkeitä koodataan aivoissa. Mallien ennustuskyky oli kaikilla approksimaatiomenetelmillä merkittävästi sattumanvaraista tasoa korkeampi. Piirteiden voimakkaasta karsinnasta huolimatta ARDEP pystyi kuvaamaan kaikki huomattavimmat LAEP:n ja MCMC:n erottelemat aivoalueet. ARDEP menetti kuitenkin alueiden tarkemman muodon esittämällä ne yhtenä tai useampana pienempänä alueena, poistaen myös osan merkittävistä piirteistä. |
ED: | 2012-09-21 |
INSSI record number: 45281
+ add basket
INSSI