search query: @instructor Roivainen, Merja / total: 12
reference: 8 / 12
« previous | next »
Author:Kahelin, Heidi
Title:Poliorekombinanttiviruksen alustava karakterisointi
Preliminary characterization of a recombinant poliovirus
Publication type:Master's thesis
Publication year:2008
Pages:ix + 105 s. + liitt. 9      Language:   fin
Department/School:Biotekniikan ja kemian tekniikan laitos
Main subject:Biokemia ja mikrobiologia   (Kem-30)
Supervisor:Nordström, Katrina
Instructor:Roivainen, Merja
OEVS:
Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions

Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning Centre

In the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network.

The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/

You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.

Logging on to the customer computers

  • Aalto University staff members log on to the customer computer using the Aalto username and password.
  • Other customers log on using a shared username and password.

Opening a thesis

  • On the desktop of the customer computers, you will find an icon titled:

    Aalto Thesis Database

  • Click on the icon to search for and open the thesis you are looking for from Aaltodoc database. You can find the thesis file by clicking the link on the OEV or OEVS field.

Reading the thesis

  • You can either print the thesis or read it on the customer computer screen.
  • You cannot save the thesis file on a flash drive or email it.
  • You cannot copy text or images from the file.
  • You cannot edit the file.

Printing the thesis

  • You can print the thesis for your personal study or research use.
  • Aalto University students and staff members may print black-and-white prints on the PrintingPoint devices when using the computer with personal Aalto username and password. Color printing is possible using the printer u90203-psc3, which is located near the customer service. Color printing is subject to a charge to Aalto University students and staff members.
  • Other customers can use the printer u90203-psc3. All printing is subject to a charge to non-University members.
Location:P1 Ark TKK  5076   | Archive
Abstract (fin): Tämän diplomityön tarkoituksena oli tutkia enterovirusten, erityisesti poliovirusten ja muiden HEV-C- ryhmään kuuluvien virusten rekombinaatiota sekä rekombinaatiosta seuraavia muutoksia viruksen geno- ja fenotyypissä.

Kirjallisuusosan alussa tarkastellaan yleisesti enteroviruksia, niiden luokittelua, replikaatiosykliä ja epidemiologiaa.
Työn jälkiosa käsittelee polioviruksia ja muita HEV-C-ryhmän enteroviruksia, poliorokotteita, rokotepoliovirusten attenuaatiota ja reversiota sekä enterovirusten rekombinaatiota.

Tutkimusosassa tutkittiin kahta KTL:n näytekokoelmaan kuuluvaa esikäsiteltyä näytettä.
Näytteet olivat peräisin tutkimuksesta, jossa Valko- Venäläisen lastenkodin OPV-rokotetuilta lapsilta kerättiin ulostenäytteitä 9 viikon ajan jokaisen rokotuskerran jälkeen.
Näytteet teki erityisen mielenkiintoisiksi niissä rokotepoliovirusten kanssa samaan aikaan havaitut CVA-24-virukset, sillä HEV-C-ryhmän virukset rekombinoituvat usein keskenään.
Lisäksi alustavien RFLP-analyysien perusteella työssä tutkittujen kahden näytteen viruksia oli syytä epäillä nonpolio-polio-rekombinanteiksi.

Plakkipuhdistetuista virusnäytteistä sekvensoitiin kolme kohtaa eri puolita genomia, ja tuloksista pääteltiin toisen näytteistä sisältävän S3/S1-rekombinanttivirusta.
Toinen näyte osoittautui tässä työssä tavalliseksi rokotepoliovirukseksi.
Rekombinantiksi todetun viruksen lähes koko genomisekvenssi määritettiin ja lisäksi tutkittiin rekombinantin ja sen parentaalikantojen kasvunopeutta kolmessa eri solulinjassa.

Rekombinanin S3/S1-viruksen rekombinaatiokohta määritettiin emästen 5015-5020 kohdalle, aivan 2C- helikaasia koodaavan genomin alueen päähän.
Viruksessa, jonka genomista suurin osa oli peräisin Sabin 3-rokotepoliovirukselta, oli tapahtunut kaksi kolmesta tärkeimmästä sen attenuaatioon vaikuttavasta reversiomutaatiosta.
Näistä mutaatioista ensimmäinen oli U472C replikaatiota säätelevällä 5-UTR-alueella ja toinen, C2493U, VP1-kapsidiproteiinialueella.

Rekombinanttiviruksella ja sen parentaalikannoilla tehdyissä kasvukäyrissä havaittiin viruksen muistuttavan kasvunopeudeltaan HeLa- ja hermosoluperäisissä SK-N-SH-solulinjoissa enemmän S3 :a nopeampaa S1- virusta, jolta rekombinantin genomin loppupää ja 3D-polymeraasi olivat peräisin.
Suoliston CaCo-2-solulinjassa eri kantojen välillä selvää eroa ei ollut havaittavissa.
Rekombinantin kasvunopeus ja attenuaation heikentyminen näytti siis riippuvan tutkitusta solutyypistä.

Tutkimustulokset auttavat osaltaan ymmärtämään paremmin miksi poliovirusten rekombinaatio on niin yleistä.
Työssä saadut tulokset ovat samansuuntaisia aiempien rekombinanttitutkimusten kanssa ja tukevat havaintoja rekomhinaation vaikutuksesta viruksen elinkykyyn.
ED:2008-06-02
INSSI record number: 35706
+ add basket
« previous | next »
INSSI