search query: @keyword self-assembly / total: 12
reference: 7 / 12
« previous | next »
Author:Junnila, Susanna
Title:Control of Polypeptide Self-Assembly and Conformation by Molecular Architecture
Polypeptidien itsejärjestymisen ja konformaation säätely molekyyliarkkitehtuurilla
Publication type:Licentiate thesis
Publication year:2010
Pages:viii + 47 + [22]      Language:   eng
Department/School:Teknillisen fysiikan laitos
Main subject:Optiikka ja molekyylimateriaalit   (Tfy-125)
Supervisor:Ikkala, Olli
Instructor:
OEVS:
Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions

Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning Centre

In the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network.

The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/

You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.

Logging on to the customer computers

  • Aalto University staff members log on to the customer computer using the Aalto username and password.
  • Other customers log on using a shared username and password.

Opening a thesis

  • On the desktop of the customer computers, you will find an icon titled:

    Aalto Thesis Database

  • Click on the icon to search for and open the thesis you are looking for from Aaltodoc database. You can find the thesis file by clicking the link on the OEV or OEVS field.

Reading the thesis

  • You can either print the thesis or read it on the customer computer screen.
  • You cannot save the thesis file on a flash drive or email it.
  • You cannot copy text or images from the file.
  • You cannot edit the file.

Printing the thesis

  • You can print the thesis for your personal study or research use.
  • Aalto University students and staff members may print black-and-white prints on the PrintingPoint devices when using the computer with personal Aalto username and password. Color printing is possible using the printer u90203-psc3, which is located near the customer service. Color printing is subject to a charge to Aalto University students and staff members.
  • Other customers can use the printer u90203-psc3. All printing is subject to a charge to non-University members.
Location:P1 Ark Aalto  171   | Archive
Keywords:self-assembly
polypeptide
block copolymer
surfactant
itsejärjestyminen
polypeptidi
lohkopolymeeri
surfaktantti
Abstract (eng): The aim of this thesis was to study the relation between polypeptide conformation and self-assembled structures with different supramolecular and molecular architectures.
Comb-shaped supramolecular polypeptide-surfactant complexes were studied using various surfactant architectures to tune the conformation and self-assemblies by side-chain crowding.
A star-shaped miktoarm architecture was used to study how packing of polypeptide arms can affect the self-assembly of novel non-linear block copolymers.

In Paper I, a cationic homopolypeptide poly(L-lysine) (PLL) was ionically complexed with a branched surfactant dodecylbenzenesulfonic acid (DBSA) to study thermally induced conformational and structural transformations in polypeptide - surfactant complexes.
The effect of surfactant architecture on PLL conformation and self-assembly was studied in more detail in Paper II using three different anionic phosphodiester surfactants bis(2-ethylhexyl) phosphate (diC2/6), dioctyl phosphate (diC8) and didodecyl phosphate (diCl2) which demonstrate different branchings and chain lengths.
The solvent is shown to play a major role, as the complexes prepared from aqueous solutions typically demonstrate lamellar self-assemblies with ß-sheet conformation while organic solvent treatment drives the conformation of PLL to be alpha-helical.
By contrast, PLL adopts the a-helical conformation already upon precipitation from an aqueous solvent in the complex PLL(diC2/6) 1.0., which demonstrates the bulkiest ionically bonded side chains.
The aqueous precipitated complexes PLL(diCl2) 1.0 and PLL(diCS) 1.0. demonstrated a thermally induced partial disruption of the ß-sheets.
Organic solvent treatment and plasticization led to the clearly softened PLL(DBSA) x and PLL(diC8) x complexes (where x = 1.5 - 3.0), and a thermally induced partial transformation from alpha-helical towards ß-sheet conformation was observed in the PLL(DBSA) x complexes, assisted by a structural transformation from the cylindrical to lamellar morphology.

In Paper III, the self-assembly of a miktoarm star terpolymer with polystyrene (PS), polyisoprene (PI) and poly(e-tert-butyloxycarbonyl-L-lysine) (PBLL) arms was studied.
The (PS)(PJ)(PBLL) miktoarm self-assembles in the solid state in a hierarchical smectic phase where rod-like alpha-helical PBLL and coil like PS/PI lamellae alternate.
Furthermore, an inner structure is observed where the PS and PI form rectangular cylinders.
The structure formation is driven by the liquid crystalline stacking tendency of the polypeptide block.

The concepts shown in the work allow preparation of nanostructured materials with many levels of order.
By varying the molecular architecture of the starting materials, the structures and the properties of the materials can he efficiently tuned.
Abstract (fin): Tämän työn tarkoituksena oli tutkia polypeptidin konformaation ja itsejärjestyneiden rakenteiden välistä yhteyttä käyttäen erilaisia supramolekyyli- ja molekyyliarkkitehtuureita.
Surfaktanttiarkkitehtuurin vaikutusta konformaatioon ja rakenteisiin tutkittiin kampamaisissa supramolekulaarisissa polypeptidi-surfaktantti-komplekseissa, ja polypeptidilohkojen vaikutusta epälineaaristen lohkopolymeerien itsejärjestymiseen tutkittiin epäsymmetrisessä tähtilohkopolymeerissä (engl.
'miktoarm).

Artikkelissa I kationinen homopolypeptide poly(L-lysiini) (PLL) kompleksoitiin ionisesti haaroittuneen surfaktantin, dodekyylibentseenisulfonihapon (DBSA) kanssa tutkiaksemme lämpötilalla aikaansaatuja konformaation ja rakenteen muutoksia polypeptidi-surfaktantti-komplekseissa.
Surfaktanttiarkkitehtuurin vaikutusta PLL:n konformaatioon ja itsejärjestymiseen tutkittiin tarkemmin artikkelissa II käyttäen kolmea anionista fosfodiesterisurfaktanttia: bis(2-etyyliheksyyli)fosfaattia, dioktyylifosfaattia (diC8) ja didodekyylifosfaattia (diCt2).
Vesiliuoksista valmistetut kompleksit itsejärjestyvät tyypillisesti lamellirakenteeseen PLL-ketjujen ollessa ß-laskostuneita, mutta käsittely orgaanisessa liuottimessa ajaa PLL:n konformaation alfa-helikaaliseksi.
Sitä vastoin kompleksissa PLL(diC2/6)1.0., jossa on haaroittuneimmat sivuketjut, PLL on alfa-helikaalisessa konformaatiossa jo suoraan vedestä valmistettuna.
Vedestä valmistetuissa komplekseissa PLL(diCl2)1.0. ja PLL(diC8)1.0. lämpötilan nostaminen saa aikaan osittaisen ß-laskosten aukeamisen.
Orgaanisessa liuottimessa käsitellyt ja plastisoidut kompleksit PLL(DBSA)x ja PLL(diC8) x (joissa x = 1.5 - 3.0) ovat selvästi pehmentyneitä ja PLL(DBSA) x -komplekseissa havaitaan osittainen muutos alfa-helikaalisesta ß-laskostuneeseen konformaatioon lämpötilaa nostettaessa.
Samalla itsejärjestynyt sylinterirakenne muuttuu kohti lamellirakennetta.

Artikkelissa III tutkittiin itsejärjestymistä epäsymmetrisessä tähtilohkopolymeerissä, joka koostuu polystyreenistä (PS), polyisopreenistä (PI) ja poly(e-tert-butyylioksikarbonyyli-L-lysiinistä) (PBLL).
(PS) (PI) (PBLL)-tähtilohkopolymeeri muodostaa hierarkkisen smektisen faasin, jossa sauvamaiset alfa-helikaaliset PBLL-lohkot ja amorfiset PS/PI-lamellit vuorottelevat.
Lisäksi PS ja PI muodostavat poikkileikkaukseltaan suorakaiteen muotoisia sylintereitä lamellirakenteen sisällä.
Rakenteen muodostumisen ajavana voimana on polypeptidilohkojen nestekidemäinen pakkautuminen.

Työssä esitellyillä konsepteilla voidaan valmistaa nanorakenteisia materiaaleja, joilla on järjestystä monilla eri tasoilla.
Muuttamalla lähtöaineiden molekyyliarkkitehtuuria pystytään säätämään lopullisen materiaalin rakenteita ja ominaisuuksia.
ED:2010-11-22
INSSI record number: 41349
+ add basket
« previous | next »
INSSI