search query: @keyword relational database / total: 13
reference: 7 / 13
Author: | Salmia, Ilari |
Title: | Search Systems in Bioinformatics |
Hakujärjestelmät bioinformatiikassa | |
Publication type: | Master's thesis |
Publication year: | 2004 |
Pages: | 66+11 Language: eng |
Department/School: | Tietotekniikan osasto |
Main subject: | Ohjelmistotekniikka (T-106) |
Supervisor: | Soisalon-Soininen, Eljas |
Instructor: | Volanen, Jussi |
OEVS: | Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning CentreIn the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network. The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/ You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.
Logging on to the customer computers
Opening a thesis
Reading the thesis
Printing the thesis
|
Location: | P1 Ark Aalto | Archive |
Keywords: | search system search engine bioinformatics relational database SQL hakujärjestelmä hakukone bioinformatiikka relaatiotietokanta SQL |
Abstract (fin): | Erilaisen tiedon määrä bioinformatiikassa on valtaisa. Jotta tutkija pystyisi suodattamaan haluamansa tiedon ulos, tarvitaan tehokas hakujärjestelmä, joka pystyy muuntautumaan käyttäjän tarpeisiin sopivaksi. Työssä esitellään menetelmä, kuinka tehdä monipuolisia ja monimutkaisia hakuja relaatiotietokannasta. Nämä haut voivat olla erilaisia joka kerta, eikä näin ollen tutkijan ole pakko tyytyä ennaltamääriteltyihin, kiinteisiin hakuvaihtoehtoihin. Hakujärjestelmää varten relaatiotietokantaan on yhdistetty eri biologisia tietokantoja. Nämä tietokannat ovat usein vapaasti käytettävissä ja saatavilla. Eri tieteelliset organisaatiot ylläpitävät näitä tietokantoja kukin omassa muodossaan, eikä hakuja yhdistäen eri tietokantoja samaan yhteiseen hakuun juurikaan tueta. Suunnittelun pohjalta on toteuttu käyttäen Java-ohjelmointikieltä hakujärjestelmä, joka tuottaa hakukyselyitä annetuista ehdoista. Työn kannalta hakujärjestelmän käyttäjä on toinen ohjelmisto, kuten esimerkiksi graafinen käyttöliittymä, joka tuottaa hakukyselyitä ihmiskäyttäjälle. Käyttöliittymän tehtäväksi jää muuttaa käyttäjän antamat ehdot hakujärjestelmän ymmärtämään muotoon sekä näyttämään hakutulokset. Käyttöliittymän lisäksi myös muut tietokantahakuja tarvitsevat sovellukset voivat hyödyntää rakennettua hakujärjestelmää. Hakujärjestelmä tietää, millä ehdoilla tietoa voidaan hakea, eikä tätä tietoa tarvitse kovakoodata esimerkiksi käyttöliittymään. Tämä saavutetaan muuttamalla käytössä oleva tietomalli tietokoneen ymmärtämään muotoon. Tietomalli sisältää kaiken hakujärjestelmän tarvitsevan informaation. Se tietää mitä asiakokonaisuutta voi hakea milläkin kriiterillä sekä kuinka nämä asiakokonaisuudet liittyvät toisiinsa. Tässä työssä saavutetut tulokset osoittavat, että hakujärjestelmällä pystytään tuottamaan monipuolisia hakukyselyitä. Esitetty hakuehtojen välittäminen on tarpeeksi rikas välittämään hakuehdot monimutkaisen tietomallin ollessa käytössä. |
ED: | 2004-03-03 |
INSSI record number: 21271
+ add basket
INSSI