search query: @keyword bioinformatiikka / total: 14
reference: 9 / 14
« previous | next »
Author:Lindfors, Erno
Title:Investigating the structure of integrated biological networks
Integroitujen biologisten verkkojen tutkiminen
Publication type:Master's thesis
Publication year:2005
Pages:x + 61 s. + liitt.      Language:   eng
Department/School:Sähkö- ja tietoliikennetekniikan osasto
Main subject:Tietoverkkotekniikka   (S-38)
Supervisor:Hollmén, Jaakko
Instructor:Oresic, Matej
OEVS:
Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions

Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning Centre

In the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network.

The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/

You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.

Logging on to the customer computers

  • Aalto University staff members log on to the customer computer using the Aalto username and password.
  • Other customers log on using a shared username and password.

Opening a thesis

  • On the desktop of the customer computers, you will find an icon titled:

    Aalto Thesis Database

  • Click on the icon to search for and open the thesis you are looking for from Aaltodoc database. You can find the thesis file by clicking the link on the OEV or OEVS field.

Reading the thesis

  • You can either print the thesis or read it on the customer computer screen.
  • You cannot save the thesis file on a flash drive or email it.
  • You cannot copy text or images from the file.
  • You cannot edit the file.

Printing the thesis

  • You can print the thesis for your personal study or research use.
  • Aalto University students and staff members may print black-and-white prints on the PrintingPoint devices when using the computer with personal Aalto username and password. Color printing is possible using the printer u90203-psc3, which is located near the customer service. Color printing is subject to a charge to Aalto University students and staff members.
  • Other customers can use the printer u90203-psc3. All printing is subject to a charge to non-University members.
Location:P1 Ark TKK  2702   | Archive
Keywords:data visualizing and clustering
robustness
network topologies
bioinformatics
tiedon visualisointi ja klusterointi
robustisuus
verkkotopologiat
bioinformatiikka
Abstract (fin): Nykyajan biologinen tieto on erittäin hajanaista.
Sitä säilytetään eri tietokannoissa ja se esitetään eri formaateissa.
On olemassa paljon biologisia tietokantoja hyvine visualisointityökaluineen.
Tästä huolimatta on olemassa erittäin vähän työkaluja, joiden avulla tietoa pystytään hakemaan useasta tietokannasta.
Tämän takia on erittäin vaikeata saada selvää kokonaiskuvaa monimutkaisesta biologisesta tiedosta.
Tässä työssä kehitämme Java-sovelluksen, jonka avulla voimme hakea useasta biologisesta tietokannasta.

Viimeaikaisten tutkimusten perusteella hierarkinen modulaarisuus vallitsee aineenvaihduntaverkoissa.
Tämän takia ne ovat erittäin robusteja.
Emme kuitenkaan tiedä miten tämä rakenne muuttuu, kun lisäämme aineenvaihduntaverkkoihin uusia biologisia verkkoja.

Käytämme Sammonin projektioalgoritmia tutkiaksemme biologisten verkkojen rakennetta Leipurin hiivassa.
Aluksi klusteroimme aineenvaihduntaverkkoja.
Tämän jälkeen lisäämme aineenvaihduntaverkkoihin proteiini-proteiini vuorovaikutusverkkoja.
Korkeilla hierarkiatasoilla tapahtuu voimakasta sekoitusta.
Alemmilla hierarkiatasoilla sekoitukset ovat huomattavasti heikompia.
Korkeiden ja matalien hierarkiatasojen välillä ei tapahdu ollenkaan sekoitusta.
ED:2005-06-20
INSSI record number: 28891
+ add basket
« previous | next »
INSSI