search query: @keyword genotyyppi / total: 2
reference: 2 / 2
« previous | next »
Author: | Nguyen, Trang |
Title: | Vesivälitteinen norovirusepidemia Nokialla talvella 2007 |
Norovirus infection and epidemiology during Nokia's waterborne outbrake in 2007 | |
Publication type: | Master's thesis |
Publication year: | 2008 |
Pages: | viii + 67 (+5) Language: fin |
Department/School: | Biotekniikan ja kemian tekniikan laitos |
Main subject: | Biokemia ja mikrobiologia (Kem-30) |
Supervisor: | Nordström, Katrina |
Instructor: | Roivainen, Merja |
OEVS: | Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning CentreIn the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network. The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/ You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.
Logging on to the customer computers
Opening a thesis
Reading the thesis
Printing the thesis
|
Location: | P1 Ark TKK 4227 | Archive |
Keywords: | norovirus genogroup genotype norovirus genoryhmä genotyyppi |
Abstract (fin): | Norovirusta on tutkittu vasta viime vuosikymmeninä ja viruksesta tiedetään vähän. Norovirus aiheuttaa kuitenkin eniten mahasuolitulehdusepidemioita maailmalla. Noroviruksen tutkiminen: esim. infektiotapojen ja evoluution ymmärtäminen voisi omalta osaltaan auttaa ehkäisemään näitä epidemioita ja toisi mm. huomattavaa kansantaloudellista säästöä. Näistä lähtökohdista tämän työn tarkoituksena oli tutkia noroviruksen esiintymistä ja epidemiologiaa Nokialla 2007. Nokian jätevesikriisi tapahtui vuoden 2007 marraskuun lopussa, kun venttiili, joka yhdisti puhdas ja jäteveden oli auki keskiviikosta perjantaihin (28.-30.11.2007). Vesikriisin oletettiin vaikuttavan noin 10 000 henkilöön. Kirjallisuusosiossa tarkastellaan kalikiviruksia ja tarkemmin noroviruksia. Perehdytään noroviruksen luokitteluun, patogeneesiin, infektioon, epidemiologiaan, diagnostiikkaan, hoitoon ja ennaltaehkäisyyn sekä hiiren noroviruksen solukasvatukseen. Tutkimusosassa analysoitiin ulostenäytteitä, jotka oli kerätty potilailta Nokian jätevesikriisin aikaan. Näytteet oli kerätty aikaväliltä 5.12.2007-9.1.2008 nokialaisilta, jotka hakeutuivat sairaalahoitoon. Näytteille suoritettiin aluksi ulostenäytteen esikäsittely, RNA-eristys ja reaaliaikainen RT-PCR noroviruksen genoryhmille GII ja GI. Reaaliaikaisen RT-PCR-ajojen perusteella valittiin voimakkaasti positiiviset norovirusnäytteet, joille suoritettiin RT-PCR-ajo polymeraasi- ja kuori-alueelta. RT-PCR-ajon jälkeen PCR-tuotteet puhdistettiin, jonka jälkeen ne sekvensoitiin ja geno-tyypitettiin. Tutkittavia näytteitä oli yhteensä 294 ja niistä noroviruspositiivisia oli yhteensä 115 eli noin 39,2 %. GII-positiivisia oli 70 (24 %) ja GI-positiivisia 45 (15 %). Näytteet, jotka olivat infektoituneet molemmilla genoryhmillä, löytyi kymmenen kappaletta. Vallitseva genotyyppi oli GII.4 2006b- kanta. Muita löydettyjä genotyyppejä oli GII.7, GII.b, GII.3, GII.6, GI.4, GI.3 ja GI.11. Rekombinaatiota oli tapahtunut kahdella näytteellä. Näillä näytteillä polymeraasi- ja kuorialueen sekvenssit olivat keskenään eri genotyyppiä. Tutkimustulokset auttavat ymmärtämään noroviruksen epidemiologiaa yksittäisen norovirusepidemian aikana. Tilanne on ollut Nokialla 2007 ainutlaatuinen, sillä potilaat ovat altistuneet suurelle määrälle patogeenejä, joista norovirus on ollut yleisin infektiota aiheuttava. |
ED: | 2008-12-17 |
INSSI record number: 36628
+ add basket
« previous | next »
INSSI