search query: @keyword genotyyppi / total: 2
reference: 2 / 2
« previous | next »
Author:Nguyen, Trang
Title:Vesivälitteinen norovirusepidemia Nokialla talvella 2007
Norovirus infection and epidemiology during Nokia's waterborne outbrake in 2007
Publication type:Master's thesis
Publication year:2008
Pages:viii + 67 (+5)      Language:   fin
Department/School:Biotekniikan ja kemian tekniikan laitos
Main subject:Biokemia ja mikrobiologia   (Kem-30)
Supervisor:Nordström, Katrina
Instructor:Roivainen, Merja
OEVS:
Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions

Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning Centre

In the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network.

The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/

You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.

Logging on to the customer computers

  • Aalto University staff members log on to the customer computer using the Aalto username and password.
  • Other customers log on using a shared username and password.

Opening a thesis

  • On the desktop of the customer computers, you will find an icon titled:

    Aalto Thesis Database

  • Click on the icon to search for and open the thesis you are looking for from Aaltodoc database. You can find the thesis file by clicking the link on the OEV or OEVS field.

Reading the thesis

  • You can either print the thesis or read it on the customer computer screen.
  • You cannot save the thesis file on a flash drive or email it.
  • You cannot copy text or images from the file.
  • You cannot edit the file.

Printing the thesis

  • You can print the thesis for your personal study or research use.
  • Aalto University students and staff members may print black-and-white prints on the PrintingPoint devices when using the computer with personal Aalto username and password. Color printing is possible using the printer u90203-psc3, which is located near the customer service. Color printing is subject to a charge to Aalto University students and staff members.
  • Other customers can use the printer u90203-psc3. All printing is subject to a charge to non-University members.
Location:P1 Ark TKK  4227   | Archive
Keywords:norovirus
genogroup
genotype
norovirus
genoryhmä
genotyyppi
Abstract (fin): Norovirusta on tutkittu vasta viime vuosikymmeninä ja viruksesta tiedetään vähän.
Norovirus aiheuttaa kuitenkin eniten mahasuolitulehdusepidemioita maailmalla.
Noroviruksen tutkiminen: esim. infektiotapojen ja evoluution ymmärtäminen voisi omalta osaltaan auttaa ehkäisemään näitä epidemioita ja toisi mm. huomattavaa kansantaloudellista säästöä.
Näistä lähtökohdista tämän työn tarkoituksena oli tutkia noroviruksen esiintymistä ja epidemiologiaa Nokialla 2007.
Nokian jätevesikriisi tapahtui vuoden 2007 marraskuun lopussa, kun venttiili, joka yhdisti puhdas ja jäteveden oli auki keskiviikosta perjantaihin (28.-30.11.2007).
Vesikriisin oletettiin vaikuttavan noin 10 000 henkilöön.

Kirjallisuusosiossa tarkastellaan kalikiviruksia ja tarkemmin noroviruksia.
Perehdytään noroviruksen luokitteluun, patogeneesiin, infektioon, epidemiologiaan, diagnostiikkaan, hoitoon ja ennaltaehkäisyyn sekä hiiren noroviruksen solukasvatukseen.

Tutkimusosassa analysoitiin ulostenäytteitä, jotka oli kerätty potilailta Nokian jätevesikriisin aikaan.
Näytteet oli kerätty aikaväliltä 5.12.2007-9.1.2008 nokialaisilta, jotka hakeutuivat sairaalahoitoon.
Näytteille suoritettiin aluksi ulostenäytteen esikäsittely, RNA-eristys ja reaaliaikainen RT-PCR noroviruksen genoryhmille GII ja GI.
Reaaliaikaisen RT-PCR-ajojen perusteella valittiin voimakkaasti positiiviset norovirusnäytteet, joille suoritettiin RT-PCR-ajo polymeraasi- ja kuori-alueelta.
RT-PCR-ajon jälkeen PCR-tuotteet puhdistettiin, jonka jälkeen ne sekvensoitiin ja geno-tyypitettiin.

Tutkittavia näytteitä oli yhteensä 294 ja niistä noroviruspositiivisia oli yhteensä 115 eli noin 39,2 %.
GII-positiivisia oli 70 (24 %) ja GI-positiivisia 45 (15 %).
Näytteet, jotka olivat infektoituneet molemmilla genoryhmillä, löytyi kymmenen kappaletta.
Vallitseva genotyyppi oli GII.4 2006b- kanta.
Muita löydettyjä genotyyppejä oli GII.7, GII.b, GII.3, GII.6, GI.4, GI.3 ja GI.11.
Rekombinaatiota oli tapahtunut kahdella näytteellä.
Näillä näytteillä polymeraasi- ja kuorialueen sekvenssit olivat keskenään eri genotyyppiä.

Tutkimustulokset auttavat ymmärtämään noroviruksen epidemiologiaa yksittäisen norovirusepidemian aikana.
Tilanne on ollut Nokialla 2007 ainutlaatuinen, sillä potilaat ovat altistuneet suurelle määrälle patogeenejä, joista norovirus on ollut yleisin infektiota aiheuttava.
ED:2008-12-17
INSSI record number: 36628
+ add basket
« previous | next »
INSSI