search query: @supervisor Seppälä, Jukka / total: 257
reference: 19 / 257
« previous | next »
Author:Haka, Jaana
Title:Development of surface binding peptides using phage display
Pinnalle sitoutuvien peptidien kehittäminen faaginäyttömenetelmän avulla
Publication type:Master's thesis
Publication year:2012
Pages:[7] + 68      Language:   eng
Department/School:Biotekniikan ja kemian tekniikan laitos
Main subject:Polymeeriteknologia   (Kem-100)
Supervisor:Seppälä, Jukka
Instructor:Linder, Markus ; Szilvay, Géza
OEVS:
Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions

Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning Centre

In the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network.

The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/

You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.

Logging on to the customer computers

  • Aalto University staff members log on to the customer computer using the Aalto username and password.
  • Other customers log on using a shared username and password.

Opening a thesis

  • On the desktop of the customer computers, you will find an icon titled:

    Aalto Thesis Database

  • Click on the icon to search for and open the thesis you are looking for from Aaltodoc database. You can find the thesis file by clicking the link on the OEV or OEVS field.

Reading the thesis

  • You can either print the thesis or read it on the customer computer screen.
  • You cannot save the thesis file on a flash drive or email it.
  • You cannot copy text or images from the file.
  • You cannot edit the file.

Printing the thesis

  • You can print the thesis for your personal study or research use.
  • Aalto University students and staff members may print black-and-white prints on the PrintingPoint devices when using the computer with personal Aalto username and password. Color printing is possible using the printer u90203-psc3, which is located near the customer service. Color printing is subject to a charge to Aalto University students and staff members.
  • Other customers can use the printer u90203-psc3. All printing is subject to a charge to non-University members.
Location:P1 Ark Aalto  726   | Archive
Keywords:biopanning
hydrophobin
surface binding peptide
kirjastoseulonta
hydrofobiini
pintaan sitoutuva peptidi
Abstract (eng): Finding tools for optimizing the performance of biomedical materials is under continuous research.
In this thesis, a unique strategy for surface functionalization using material-specific peptides generated via phage display is presented.
Phage display is a powerful selection method that enables screening of a large library of randomly generated peptides in favour of peptide sequences with the highest binding affinity to a particular surface via process called biopanning.
These peptides could be utilized as binding agents or linkers in the construction of novel nanobiomaterials and control the organization, self-assembly and specific functions of the biomaterial.
Besides synthetic peptides, the utilization of natural adhesive proteins, such as hydrophobins and mussel adhesive proteins are discussed in order to discover novel strategies for surface engineering of biomedical material applications.

The aim is to find peptides suitable for surface functionalization of a fungal adhesive protein, hydrophobin, which has been successfully researched as a coating material for various biomedical applications.
A bacteriophage library was used to screen 109 different 12-mer peptides against hydrophobin protein layer.
The binding affinity and specificity of the selected phage display derived peptides were assessed using titer count analysis, enzyme-linked immunosorbent assay and quartz crystal microbalance with dissipation monitoring.

The biopanning resulted in hydrophilic peptides that show binding on hydrophobin protein layer.
However, no consensus sequence was observed and some of the peptide sequences seemed to be target unrelated peptides.
There were significant differences in binding affinity between the phage variants, and the best variants were HFBbp2-l3 and HFBbp2-l6.
Surprisingly, the binding of the phages was not selective to hydrophobin protein only but binding was observed to plastics as well.
The binding properties were verified using isolated synthetic peptides of the best phage variants.
Abstract (fin): Tekniikoita lääketieteellisten materiaalien toimintakyvyn parantamiseksi kehitetään jatkuvasti.
Tässä diplomityössä esitetään yksi ratkaisu materiaalin pinnan muokkaamiseen käyttäen faaginäyttö-menetelmällä pintaan spesifisesti sitoutuvia peptidejä.
Faaginäyttö on tehokas seulontamenetelmä, jonka avulla suuria määriä peptidiehdokkaita sisältävistä kirjastoista voidaan seuloa voimakkaimmin tiettyyn pintaan sitoutuvat peptidit seulontatekniikalla.
Näitä pintaan spesifisesti sitoutuvia peptidejä voidaan hyödyntää pinnan muokkaajina tai sidosaineina uusien nanobiomateriaalien rakenteen sekä ominaisuuksien kehittelyssä.
Synteettisten peptidien lisäksi diplomityössä käsitellään myös luonnosta peräisin olevien adhesiivien, kuten hydrofobiiniproteiinin ja simpukan jalan proteiinien hyödyntämistä lääketieteellisten materiaalien pinnan muokkaamisessa.

Diplomityössä kehitetään faaginäyttö-menetelmän avulla pintaspesifisiä peptidejä rihmasienen tuottaman adhesiiviproteiinin, hydrophobiinin, pinnan muokkaamiseen.
Hydrofobiinin soveltuvuutta lääketieteellisten materiaalien pinnoitusmateriaalina on tutkittu tuloksekkaasti jo aiemmin.
Hydrofobiiniin sitoutuvia peptidejä seulottiin bakteriofaagikirjastosta, joka sisalisi 109 erilaista 12 aminohapon pituista peptidiä faagien pinnalla.
Valittujen peptidien sitoutumisaffiniteettia ja -spesifisyyttä hydrofobiiniin tutkittiin tiitterianalyysien, entsyymivälitteisen immunosorbenttimäärityksen sekä kvartsikide mikrovaaka -menetelmän avulla.

Kirjastoseulonta tuotti hydrofiilisia peptidejä, jotka kokeiden mukaan kiinnittyivät hydrofobiinipintaan.
Selektoiduissa peptidisekvensseissä ei ollut havaittavissa konsensussekvenssiä, eikä kaikkien peptidien selektoitumisen ajavista voimista oltu täysin varmoja.
Sitoutumisaffiniteetti vaihteli suuresti eri faagien välillä, ja parhaat hydrofobiiniin sitoutujat olivat HFBbp2-13 ja HFBbp2-16.
Sitoutumiskokeiden perusteella peptidit eivät olleet spesifisiä ainoastaan hydrofobiinille, vaan ne kiinnittyivät myös muovipinnoille.
Sitoutumisominaisuudet vahvistettiin myös tutkimalla kiinnittymistä synteettisillä peptideillä, jotka vastasivat parhaiten sitoutuvien faagien sisältämää peptidiä.
ED:2012-07-09
INSSI record number: 45009
+ add basket
« previous | next »
INSSI