search query: @keyword dynamic modelling / total: 3
reference: 2 / 3
« previous | next »
Author:Pykälä, Heli
Title:Dynamic modelling of very high dimensional data - Application in gene expression
Erittäin korkeaulotteisen datan dynaaminen mallitus - Sovellus geeniekspressioon
Publication type:Master's thesis
Publication year:2005
Pages:56 s. + liitt.      Language:   eng
Department/School:Automaatio- ja systeemitekniikan osasto
Main subject:Systeemitekniikka   (AS-74)
Supervisor:Hyötyniemi, Heikki
Instructor:Haavisto, Olli
OEVS:
Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions

Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning Centre

In the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network.

The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/

You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.

Logging on to the customer computers

  • Aalto University staff members log on to the customer computer using the Aalto username and password.
  • Other customers log on using a shared username and password.

Opening a thesis

  • On the desktop of the customer computers, you will find an icon titled:

    Aalto Thesis Database

  • Click on the icon to search for and open the thesis you are looking for from Aaltodoc database. You can find the thesis file by clicking the link on the OEV or OEVS field.

Reading the thesis

  • You can either print the thesis or read it on the customer computer screen.
  • You cannot save the thesis file on a flash drive or email it.
  • You cannot copy text or images from the file.
  • You cannot edit the file.

Printing the thesis

  • You can print the thesis for your personal study or research use.
  • Aalto University students and staff members may print black-and-white prints on the PrintingPoint devices when using the computer with personal Aalto username and password. Color printing is possible using the printer u90203-psc3, which is located near the customer service. Color printing is subject to a charge to Aalto University students and staff members.
  • Other customers can use the printer u90203-psc3. All printing is subject to a charge to non-University members.
Location:P1 Ark TKK  6640   | Archive
Keywords:dynamic modelling
subspace identification
gene expression
DNA microarray
dynaaminen mallitus
aliavaruusidentifiointi
geeniekspressio
DNA-mikrosiru
Abstract (fin):Perinteiset mallitusalgoritmit eivät suoriudu tehtävästään, jos datan dimensio on suurempi kuin näytteiden määrä (erittäin korkeaulotteinen data).
Tällaiseen tilanteeseen törmätään muunmuassa geeniekspression mallituksessa.
DNA-mikrosirutekniikan avulla on mahdollista määrittää koko genomin aktiivisuus samalla aikahetkellä, mikä tuottaa tuhansia aktiivisuusarvoja.
Mittausten kalleudesta johtuen näytteitä on saatavilla korkeintaan joistain sadoista aikapisteistä.

Jotta tällaisen datan dynaaminen mallittaminen olisi mahdollista, datan dimensiota on pienennettävä jollain redusointitekniikalla.
Perinteisesti geeniekspression mallituksessa dimensiota on redusoitu ennen mallitusta esimerkiksi jättämällä osa geeneistä tarkastelun ulkopuolelle.

Tässä työssä käytetään mallitukseen aliavaruusidentifiointia, jolla monimuuttujadatasta voidaan laskea suoraan matalaulotteinen lineaarinen tilamalli.
Menetelmä muokataan soveltuvaksi erittäin korkeaulotteisen datan mallitukseen ja muokatun algoritmin toimivuutta arvioidaan simuloidun datan avulla.
Lopuksi menetelmää sovelletaan myös geeniekspressio-datan mallitukseen.

Työssä havaitaan, että menetelmä on sovellettavissa erittäin korkeaulotteisen datan mallitukseen, joskin siinä on joitakin puutteita.
Tulokset geeniekspression mallituksessa ovat vertailukelpoisia kirjallisuudessa esitettyjen menetelmien kanssa huolimatta saatavilla olevan datan huonolaatuisuudesta.
ED:2005-11-22
INSSI record number: 29988
+ add basket
« previous | next »
INSSI