search query: @keyword lipid bilayer / total: 4
reference: 2 / 4
« previous | next »
Author:Ollila, Samuli
Title:Lateral pressure profile calculations of lipid membranes from atomic scale molecular dynamics simulations
Lipidikalvojen lateraalisen paineen laskeminen atomitason molekyylidynamiikkaa käyttäen
Publication type:Master's thesis
Publication year:2006
Pages:64      Language:   eng
Department/School:Teknillisen fysiikan ja matematiikan osasto
Main subject:Fysiikka   (Tfy-3)
Supervisor:Ala-Nissilä, Tapio
Instructor:Hyvönen, Marja ; Vattulainen, Ilpo
OEVS:
Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions

Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning Centre

In the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network.

The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/

You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.

Logging on to the customer computers

  • Aalto University staff members log on to the customer computer using the Aalto username and password.
  • Other customers log on using a shared username and password.

Opening a thesis

  • On the desktop of the customer computers, you will find an icon titled:

    Aalto Thesis Database

  • Click on the icon to search for and open the thesis you are looking for from Aaltodoc database. You can find the thesis file by clicking the link on the OEV or OEVS field.

Reading the thesis

  • You can either print the thesis or read it on the customer computer screen.
  • You cannot save the thesis file on a flash drive or email it.
  • You cannot copy text or images from the file.
  • You cannot edit the file.

Printing the thesis

  • You can print the thesis for your personal study or research use.
  • Aalto University students and staff members may print black-and-white prints on the PrintingPoint devices when using the computer with personal Aalto username and password. Color printing is possible using the printer u90203-psc3, which is located near the customer service. Color printing is subject to a charge to Aalto University students and staff members.
  • Other customers can use the printer u90203-psc3. All printing is subject to a charge to non-University members.
Location:P1 Ark TF80     | Archive
Keywords:lateral pressure profile
lipid bilayer
cell membrane
molecular dynamics simulations
polyunsaturation
lateraalinen painejakauma
lipidikaksoiskerros
solukalvo
molekyylidynamiikkamenetelmä
monityydyttymättömät rasvat
Abstract (fin):Muutaman nanometrin paksuiset solukalvot sisältävät useita erilaisia molekyylejä (esim. rasvoja, proteiineja ja sokereita).
Solukalvon perusrakenteen muodostaa lipidimolekyyleistä muodostuva kaksoiskalvo, mutta funktionaaliset ominaisuudet ovat pääasiassa proteiinien säätelemiä.
Proteiinien funktionaalisuuden on kuitenkin huomattu riippuvan ympäristön lipidimolekyyleistä, joten myös puhtaan solukalvokerroksen ominaisuudet saattavat olla funktionaalisesti merkittäviä.
Vielä ei kuitenkaan tiedetä miksi ja miten ympärillä olevat lipidit vaikuttavat proteiinien toimintaan.

1990-luvun lopussa esitetyn hypoteesin mukaan painejakauman muutokset lipidikaksoiskerroksessa saattavat aiheuttaa muutoksia proteiinien toiminnassa.
Tämän hypoteesin testaus on kuitenkin hankalaa, koska paine-eroja pienien etäisyyksien (~10-9 m) välillä ei pystytä vielä kokeellisesti mittaamaan ja paikallisen paineen määritteleminen teoreettisesti näillä etäisyyksillä on hankalaa.

Painejakauma kaksoiskerroksen sisällä on kiinnostava myös yleisemmällä tasolla, koska se yhdistää mikroskooppiset kaksoiskerroksen ominaisuudet kalvon jatkumo-ominaisuuksiin.

Tässä työssä on kehitetty menetelmä painejakauman laskemiseksi lipidikaksoiskerroksen sisällä käyttäen atomitason molekyylidynamiikkamenetelmää.
Myös kaksoissidosten vaikutusta painejakaumaan tutkittiin ja havaittiin, että kaksoissidokset pienentävät painetta kaksoiskerroksen sisällä, mikä saattaa selittää havaitun kaksoissidosten vaikutuksen kalvoproteiinien toimintaan.
ED:2006-09-27
INSSI record number: 32419
+ add basket
« previous | next »
INSSI