search query: @supervisor Koskinen, Ari / total: 62
results-list
reference: 25 / 62
« previous | next »
Author:Fagerholm, Annika
Title:Calyculin and related marine natural products as serine threonine protein phosphatase inhibitors, synthesis of C1 - C8, tetraene subunit
Meriperäinen luonnonaine kalikuliini ja sen kaltaiset aineet seriini ja treoniini proteiinifosfataasi-inhibiittoreina, tetraeeni C1 - C8:n synteesi
Publication type:Master's thesis
Publication year:2010
Pages:99 + [8]      Language:   eng
Department/School:Kemian laitos
Main subject:Orgaaninen kemia   (Kem-4)
Supervisor:Koskinen, Ari
Instructor:Habrant, Damien
OEVS:
Electronic archive copy is available via Aalto Thesis Database.
Instructions
close

Reading digital theses in the closed network of the Aalto University Harald Herlin Learning Centre

In the closed network of Learning Centre you can read digital and digitized theses not available in the open network.

The Learning Centre contact details and opening hours: https://learningcentre.aalto.fi/en/harald-herlin-learning-centre/

You can read theses on the Learning Centre customer computers, which are available on all floors.

Logging on to the customer computers

  • Aalto University staff members log on to the customer computer using the Aalto username and password.
  • Other customers log on using a shared username and password.

Opening a thesis

  • On the desktop of the customer computers, you will find an icon titled:

    Aalto Thesis Database

  • Click on the icon to search for and open the thesis you are looking for from Aaltodoc database. You can find the thesis file by clicking the link on the OEV or OEVS field.

Reading the thesis

  • You can either print the thesis or read it on the customer computer screen.
  • You cannot save the thesis file on a flash drive or email it.
  • You cannot copy text or images from the file.
  • You cannot edit the file.

Printing the thesis

  • You can print the thesis for your personal study or research use.
  • Aalto University students and staff members may print black-and-white prints on the PrintingPoint devices when using the computer with personal Aalto username and password. Color printing is possible using the printer u90203-psc3, which is located near the customer service. Color printing is subject to a charge to Aalto University students and staff members.
  • Other customers can use the printer u90203-psc3. All printing is subject to a charge to non-University members.
Location:P1 Ark Aalto  3713   | Archive
Keywords:marine natural products
total synthesis
protein phosphatase inhibitors
Pd-catalyzed cross coupling
meriperäiset luonnonaineet
kokonaissynteesi
proteiinifosfataasi-inhibiittorit
Pd-katalysoidut kytkennät
Abstract (eng): Calyculins, highly cytotoxic polyketides, originally isolated from marine sponge Discodermia calyx by Fusetani and co-workers, belong to the group of Lithistid sponges.
These molecules have become an interesting target for cell biologists and synthetic organic chemists.
The serine/threonine protein phosphatases play an essential role in the cellular signalling, metabolism, and cell cycle control.
Calyculins express potent protein phosphatase 1 and 2A inhibitory activity, and have therefore become valuable tools for cellular biologists studying intracellular processes and their control by reversible phosphorylation.
Calyculins might also play an important role in the development of several diseases such as cancer, neurodegenerative diseases, and type 2- diabetes mellitus.

The fascinating structures of calyculins have inspired various groups of synthetic organic chemists to develop total syntheses of the most abundant calyculins A and C.
However, with fifteen chiral centres, a cyano-capped tetraene unit, a phosphate-bearing spiroketal, an anti, anti, anti dipropionate segment, an alpha-chiral oxazole, and a trihydroxylated gamma-amino acid, calyculins reach versatility that only few natural products can surpass, and truly challenge chemists' knowledge of modern asymmetric synthesis.

The literature review of this thesis discusses the role of protein phosphatases, naturally occurring toxins that inhibit protein phosphatases focusing on calyculins their origin and binding properties.
The previous efforts, their advantages and downsides, towards total synthesis of calyculin A, B, and, C were also discussed in detail.
The experimental part of this thesis focused on synthesis of C1-C8 tetraene subunit of calyculin C in detail on synthesis of C1-C5 diene.
The key ideas of the synthesis were to construct vinyl nitrile with a good leaving group and further use Pd-catalyzed cross coupling to form the diene 33.
Abstract (fin): Kalikuliinit ovat ryhmä hyvin sytotoksisia polyketideitä ja niitä eristi ensikerran Fusetani et. al. meressä esiintyvästä sienestä Discodermia calyx, joka kuuluu Lithistide sieniin.
Näistä molekyyleistä on tullut kiintoisa kohde solubiologeille ja synteettisille orgaanisille kemisteille.
Seriini/treoniini proteiinifosfataaseilla on tärkeä rooli solujen signaalien välityksessä, metaboliassa ja solusyklin kontrolloinnissa.
Kalikuliinien on todettu olevan potentiaalisia proteiini fosfataasiinhibiittoreita, ja siksi niistä on tullut tärkeä työkalu solubiologeille tutkittaessa solujen sisäisiä prosesseja ja niiden kontrollointia reversiibelillä foforylaatiolla.
On myös mahdollista, että kalikuliineilla voitaisiin vaikuttaa useiden sairauksien, kuten syövän, neurologisten rappeumasairauksien sekä tyypin 2 diabeteksen synnyssä.

Kalikuliinien, erityisesti keskeisimpien kalikuliini A:n ja C:n, kiehtova rakenne on innoittanut useita synteettisen orgaanisen kemian ryhmiä kehittämään kokonaissynteesiä näille molekyyleille.
Näiden molekyylien rakenteessa on kuitenkin viisitoista kiraliakeskusta, syaani päätyinen tetraeeni ryhmä, fosfataasi-spiroketaali, anti, anti, anti dipropionaatti osa, 0-kiraalinen oksatsoli ja trihydroksyloitu 0-aminohappo.
Harvan luonnonaineen rakenne yltää monimutkaisuudessaan tälle tasolle.
Tämä rakenne todella haastaa kemistin modernin asymmetrisen synteesin tietämyksen.

Tämän työn kirjallisessa osassa tarkastellaan proteiinifosfataasien roolia, sekä niitä inhiboivien luonnossa esiintyvien toksiinien, erityisesti kalikuliinien, alkuperää, ja sitoutumisominaisuuksia.
Lisäksi tarkastellaan kalikuliini A, B ja C:n aikaisempia kokonaissynteesejä, niiden vahvuuksia ja heikkouksia.

Työn kokeellisessa osassa keskityttiin tetraeeni C1-C8:n ja erityisesti C1-C5 dieenin synteesiin.
Keskeisenä ajatuksena oli syntetisoida vinyyli nitriili molekyyli, jossa olisi myös hyvä lähtevä ryhmä, jolloin voitaisiin käyttää Pd-katalysoitua kytkentää dieeni 33:n syntetisointiin.
ED:2010-02-19
INSSI record number: 39028
+ add basket
« previous | next »
INSSI